Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2N2

Utp4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp4Q8R2N2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Utp4Q8R2N2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Utp4Q8R2N2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Utp4Q8R2N2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Utp4Q8R2N2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Utp4Q8R2N2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Utp4Q8R2N2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Utp4Q8R2N2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Utp4Q8R2N2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Utp4Q8R2N2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Utp4Q8R2N2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Utp4Q8R2N2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Utp4Q8R2N2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Utp4Q8R2N2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Utp4Q8R2N2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Utp4Q8R2N2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Utp4Q8R2N2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Utp4Q8R2N2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Utp4Q8R2N2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Utp4Q8R2N2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Utp4Q8R2N2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Utp4Q8R2N2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Utp4Q8R2N2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Utp4Q8R2N2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Utp4Q8R2N2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Utp4Q8R2N2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Utp4Q8R2N2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Utp4Q8R2N2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Utp4Q8R2N2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Utp4Q8R2N2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Utp4Q8R2N2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Utp4Q8R2N2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Utp4Q8R2N2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Utp4Q8R2N2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Utp4Q8R2N2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Utp4Q8R2N2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Utp4Q8R2N2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Utp4Q8R2N2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Utp4Q8R2N2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Utp4Q8R2N2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Utp4Q8R2N2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Utp4Q8R2N2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Utp4Q8R2N2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Utp4Q8R2N2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Utp4Q8R2N2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Utp4Q8R2N2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Utp4Q8R2N2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Utp4Q8R2N2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Utp4Q8R2N2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Utp4Q8R2N2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Utp4Q8R2N2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Utp4Q8R2N2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Utp4Q8R2N2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Utp4Q8R2N2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Utp4Q8R2N2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Utp4Q8R2N2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Utp4Q8R2N2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Utp4Q8R2N2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Utp4Q8R2N2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Utp4Q8R2N2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Utp4Q8R2N2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Utp4Q8R2N2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Utp4Q8R2N2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Utp4Q8R2N2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Utp4Q8R2N2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Utp4Q8R2N2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Utp4Q8R2N2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Utp4Q8R2N2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Utp4Q8R2N2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Utp4Q8R2N2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Utp4Q8R2N2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Utp4Q8R2N2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Utp4Q8R2N2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Utp4Q8R2N2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Utp4Q8R2N2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Utp4Q8R2N2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Utp4Q8R2N2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Utp4Q8R2N2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Utp4Q8R2N2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Utp4Q8R2N2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Utp4Q8R2N2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Utp4Q8R2N2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Utp4Q8R2N2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Utp4Q8R2N2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Utp4Q8R2N2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Utp4Q8R2N2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Utp4Q8R2N2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Utp4Q8R2N2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Utp4Q8R2N2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Utp4Q8R2N2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Utp4Q8R2N2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Utp4Q8R2N2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Utp4Q8R2N2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Utp4Q8R2N2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Utp4Q8R2N2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Utp4Q8R2N2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Utp4Q8R2N2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Utp4Q8R2N2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Utp4Q8R2N2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Utp4Q8R2N2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms