Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2K8

Uncharacterized protein C1orf54 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8R2K8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20,59■□□□□ 0,89
Q8R2K8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20,59■□□□□ 0,89
Q8R2K8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,59■□□□□ 0,89
Q8R2K8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20,58■□□□□ 0,89
Q8R2K8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,57■□□□□ 0,88
Q8R2K8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,57■□□□□ 0,88
Q8R2K8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,57■□□□□ 0,88
Q8R2K8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20,56■□□□□ 0,88
Q8R2K8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,56■□□□□ 0,88
Q8R2K8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,56■□□□□ 0,88
Q8R2K8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20,55■□□□□ 0,88
Q8R2K8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20,54■□□□□ 0,88
Q8R2K8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20,54■□□□□ 0,88
Q8R2K8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,54■□□□□ 0,88
Q8R2K8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20,53■□□□□ 0,88
Q8R2K8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,53■□□□□ 0,88
Q8R2K8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20,53■□□□□ 0,88
Q8R2K8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20,53■□□□□ 0,88
Q8R2K8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,52■□□□□ 0,88
Q8R2K8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,52■□□□□ 0,88
Q8R2K8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20,52■□□□□ 0,88
Q8R2K8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,51■□□□□ 0,87
Q8R2K8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,51■□□□□ 0,87
Q8R2K8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,51■□□□□ 0,87
Q8R2K8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20,51■□□□□ 0,87
Q8R2K8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,5■□□□□ 0,87
Q8R2K8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,5■□□□□ 0,87
Q8R2K8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,5■□□□□ 0,87
Q8R2K8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,49■□□□□ 0,87
Q8R2K8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20,49■□□□□ 0,87
Q8R2K8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20,49■□□□□ 0,87
Q8R2K8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20,48■□□□□ 0,87
Q8R2K8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20,48■□□□□ 0,87
Q8R2K8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20,48■□□□□ 0,87
Q8R2K8 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,47■□□□□ 0,87
Q8R2K8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20,47■□□□□ 0,87
Q8R2K8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20,47■□□□□ 0,87
Q8R2K8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20,46■□□□□ 0,87
Q8R2K8 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,46■□□□□ 0,87
Q8R2K8 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,46■□□□□ 0,87
Q8R2K8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,46■□□□□ 0,87
Q8R2K8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,46■□□□□ 0,87
Q8R2K8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20,46■□□□□ 0,87
Q8R2K8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,45■□□□□ 0,86
Q8R2K8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,45■□□□□ 0,86
Q8R2K8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20,45■□□□□ 0,86
Q8R2K8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20,45■□□□□ 0,86
Q8R2K8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20,45■□□□□ 0,86
Q8R2K8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,45■□□□□ 0,86
Q8R2K8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20,44■□□□□ 0,86
Q8R2K8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,44■□□□□ 0,86
Q8R2K8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20,44■□□□□ 0,86
Q8R2K8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,44■□□□□ 0,86
Q8R2K8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,44■□□□□ 0,86
Q8R2K8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,43■□□□□ 0,86
Q8R2K8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC20,42■□□□□ 0,86
Q8R2K8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,42■□□□□ 0,86
Q8R2K8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20,42■□□□□ 0,86
Q8R2K8 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,42■□□□□ 0,86
Q8R2K8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,42■□□□□ 0,86
Q8R2K8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,42■□□□□ 0,86
Q8R2K8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,42■□□□□ 0,86
Q8R2K8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,42■□□□□ 0,86
Q8R2K8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20,41■□□□□ 0,86
Q8R2K8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,41■□□□□ 0,86
Q8R2K8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,41■□□□□ 0,86
Q8R2K8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,41■□□□□ 0,86
Q8R2K8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20,41■□□□□ 0,86
Q8R2K8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,41■□□□□ 0,86
Q8R2K8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,4■□□□□ 0,86
Q8R2K8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20,4■□□□□ 0,86
Q8R2K8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,39■□□□□ 0,86
Q8R2K8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,39■□□□□ 0,85
Q8R2K8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20,38■□□□□ 0,85
Q8R2K8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,38■□□□□ 0,85
Q8R2K8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20,38■□□□□ 0,85
Q8R2K8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,37■□□□□ 0,85
Q8R2K8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,37■□□□□ 0,85
Q8R2K8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,37■□□□□ 0,85
Q8R2K8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20,37■□□□□ 0,85
Q8R2K8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,37■□□□□ 0,85
Q8R2K8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC20,36■□□□□ 0,85
Q8R2K8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,36■□□□□ 0,85
Q8R2K8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,36■□□□□ 0,85
Q8R2K8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,36■□□□□ 0,85
Q8R2K8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20,35■□□□□ 0,85
Q8R2K8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20,35■□□□□ 0,85
Q8R2K8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,35■□□□□ 0,85
Q8R2K8 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20,35■□□□□ 0,85
Q8R2K8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,34■□□□□ 0,85
Q8R2K8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,34■□□□□ 0,85
Q8R2K8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20,34■□□□□ 0,85
Q8R2K8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,33■□□□□ 0,85
Q8R2K8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20,33■□□□□ 0,85
Q8R2K8 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC20,33■□□□□ 0,85
Q8R2K8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,33■□□□□ 0,84
Q8R2K8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,32■□□□□ 0,84
Q8R2K8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,32■□□□□ 0,84
Q8R2K8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,32■□□□□ 0,84
Q8R2K8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,32■□□□□ 0,84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20,6 ms