Protein–RNA interactions for Protein: Q8R285

Vmn1r79, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r79Q8R285 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vmn1r79Q8R285 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vmn1r79Q8R285 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vmn1r79Q8R285 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vmn1r79Q8R285 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vmn1r79Q8R285 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vmn1r79Q8R285 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vmn1r79Q8R285 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vmn1r79Q8R285 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vmn1r79Q8R285 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vmn1r79Q8R285 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vmn1r79Q8R285 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vmn1r79Q8R285 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vmn1r79Q8R285 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vmn1r79Q8R285 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Vmn1r79Q8R285 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vmn1r79Q8R285 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vmn1r79Q8R285 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vmn1r79Q8R285 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vmn1r79Q8R285 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vmn1r79Q8R285 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vmn1r79Q8R285 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vmn1r79Q8R285 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vmn1r79Q8R285 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vmn1r79Q8R285 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vmn1r79Q8R285 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vmn1r79Q8R285 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vmn1r79Q8R285 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vmn1r79Q8R285 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vmn1r79Q8R285 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vmn1r79Q8R285 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vmn1r79Q8R285 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vmn1r79Q8R285 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vmn1r79Q8R285 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Vmn1r79Q8R285 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Vmn1r79Q8R285 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vmn1r79Q8R285 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vmn1r79Q8R285 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vmn1r79Q8R285 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vmn1r79Q8R285 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vmn1r79Q8R285 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vmn1r79Q8R285 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vmn1r79Q8R285 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vmn1r79Q8R285 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vmn1r79Q8R285 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vmn1r79Q8R285 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Vmn1r79Q8R285 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vmn1r79Q8R285 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vmn1r79Q8R285 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vmn1r79Q8R285 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vmn1r79Q8R285 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vmn1r79Q8R285 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vmn1r79Q8R285 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vmn1r79Q8R285 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vmn1r79Q8R285 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vmn1r79Q8R285 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vmn1r79Q8R285 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vmn1r79Q8R285 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vmn1r79Q8R285 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vmn1r79Q8R285 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vmn1r79Q8R285 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vmn1r79Q8R285 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vmn1r79Q8R285 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vmn1r79Q8R285 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vmn1r79Q8R285 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vmn1r79Q8R285 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vmn1r79Q8R285 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vmn1r79Q8R285 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vmn1r79Q8R285 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vmn1r79Q8R285 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vmn1r79Q8R285 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmn1r79Q8R285 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmn1r79Q8R285 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmn1r79Q8R285 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmn1r79Q8R285 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vmn1r79Q8R285 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vmn1r79Q8R285 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vmn1r79Q8R285 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vmn1r79Q8R285 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vmn1r79Q8R285 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vmn1r79Q8R285 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vmn1r79Q8R285 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vmn1r79Q8R285 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vmn1r79Q8R285 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vmn1r79Q8R285 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vmn1r79Q8R285 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vmn1r79Q8R285 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vmn1r79Q8R285 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vmn1r79Q8R285 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vmn1r79Q8R285 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vmn1r79Q8R285 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vmn1r79Q8R285 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Vmn1r79Q8R285 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vmn1r79Q8R285 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vmn1r79Q8R285 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vmn1r79Q8R285 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vmn1r79Q8R285 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vmn1r79Q8R285 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vmn1r79Q8R285 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vmn1r79Q8R285 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms