Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ssh3Q8K330 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ssh3Q8K330 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ssh3Q8K330 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ssh3Q8K330 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ssh3Q8K330 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ssh3Q8K330 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ssh3Q8K330 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ssh3Q8K330 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ssh3Q8K330 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ssh3Q8K330 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ssh3Q8K330 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ssh3Q8K330 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ssh3Q8K330 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ssh3Q8K330 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ssh3Q8K330 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ssh3Q8K330 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ssh3Q8K330 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ssh3Q8K330 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ssh3Q8K330 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ssh3Q8K330 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Ssh3Q8K330 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ssh3Q8K330 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ssh3Q8K330 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ssh3Q8K330 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ssh3Q8K330 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ssh3Q8K330 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ssh3Q8K330 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ssh3Q8K330 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ssh3Q8K330 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ssh3Q8K330 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ssh3Q8K330 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ssh3Q8K330 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ssh3Q8K330 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ssh3Q8K330 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ssh3Q8K330 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ssh3Q8K330 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ssh3Q8K330 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ssh3Q8K330 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ssh3Q8K330 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ssh3Q8K330 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ssh3Q8K330 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ssh3Q8K330 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ssh3Q8K330 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ssh3Q8K330 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ssh3Q8K330 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ssh3Q8K330 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ssh3Q8K330 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ssh3Q8K330 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ssh3Q8K330 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ssh3Q8K330 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ssh3Q8K330 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ssh3Q8K330 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ssh3Q8K330 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ssh3Q8K330 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ssh3Q8K330 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ssh3Q8K330 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ssh3Q8K330 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ssh3Q8K330 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ssh3Q8K330 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ssh3Q8K330 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ssh3Q8K330 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ssh3Q8K330 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ssh3Q8K330 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ssh3Q8K330 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ssh3Q8K330 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ssh3Q8K330 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ssh3Q8K330 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ssh3Q8K330 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ssh3Q8K330 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ssh3Q8K330 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ssh3Q8K330 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ssh3Q8K330 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ssh3Q8K330 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ssh3Q8K330 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ssh3Q8K330 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ssh3Q8K330 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ssh3Q8K330 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ssh3Q8K330 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ssh3Q8K330 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ssh3Q8K330 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ssh3Q8K330 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ssh3Q8K330 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ssh3Q8K330 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ssh3Q8K330 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ssh3Q8K330 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ssh3Q8K330 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ssh3Q8K330 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ssh3Q8K330 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ssh3Q8K330 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ssh3Q8K330 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ssh3Q8K330 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ssh3Q8K330 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ssh3Q8K330 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ssh3Q8K330 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ssh3Q8K330 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ssh3Q8K330 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ssh3Q8K330 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ssh3Q8K330 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ssh3Q8K330 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms