Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Y7

Mrpl47, 39S ribosomal protein L47, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl47Q8K2Y7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Mrpl47Q8K2Y7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Mrpl47Q8K2Y7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Mrpl47Q8K2Y7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mrpl47Q8K2Y7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mrpl47Q8K2Y7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mrpl47Q8K2Y7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mrpl47Q8K2Y7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mrpl47Q8K2Y7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mrpl47Q8K2Y7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mrpl47Q8K2Y7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Mrpl47Q8K2Y7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Mrpl47Q8K2Y7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Mrpl47Q8K2Y7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Mrpl47Q8K2Y7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Mrpl47Q8K2Y7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Mrpl47Q8K2Y7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mrpl47Q8K2Y7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mrpl47Q8K2Y7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mrpl47Q8K2Y7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mrpl47Q8K2Y7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mrpl47Q8K2Y7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mrpl47Q8K2Y7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mrpl47Q8K2Y7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mrpl47Q8K2Y7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mrpl47Q8K2Y7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mrpl47Q8K2Y7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mrpl47Q8K2Y7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mrpl47Q8K2Y7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mrpl47Q8K2Y7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mrpl47Q8K2Y7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mrpl47Q8K2Y7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mrpl47Q8K2Y7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mrpl47Q8K2Y7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mrpl47Q8K2Y7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mrpl47Q8K2Y7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mrpl47Q8K2Y7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mrpl47Q8K2Y7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mrpl47Q8K2Y7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mrpl47Q8K2Y7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mrpl47Q8K2Y7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mrpl47Q8K2Y7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mrpl47Q8K2Y7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mrpl47Q8K2Y7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mrpl47Q8K2Y7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mrpl47Q8K2Y7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mrpl47Q8K2Y7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mrpl47Q8K2Y7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Mrpl47Q8K2Y7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mrpl47Q8K2Y7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mrpl47Q8K2Y7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mrpl47Q8K2Y7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Mrpl47Q8K2Y7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mrpl47Q8K2Y7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mrpl47Q8K2Y7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mrpl47Q8K2Y7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mrpl47Q8K2Y7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mrpl47Q8K2Y7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mrpl47Q8K2Y7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mrpl47Q8K2Y7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mrpl47Q8K2Y7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mrpl47Q8K2Y7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mrpl47Q8K2Y7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mrpl47Q8K2Y7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Mrpl47Q8K2Y7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mrpl47Q8K2Y7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Mrpl47Q8K2Y7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mrpl47Q8K2Y7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mrpl47Q8K2Y7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mrpl47Q8K2Y7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mrpl47Q8K2Y7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Mrpl47Q8K2Y7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mrpl47Q8K2Y7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mrpl47Q8K2Y7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mrpl47Q8K2Y7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mrpl47Q8K2Y7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mrpl47Q8K2Y7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Mrpl47Q8K2Y7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mrpl47Q8K2Y7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mrpl47Q8K2Y7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Mrpl47Q8K2Y7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mrpl47Q8K2Y7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mrpl47Q8K2Y7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mrpl47Q8K2Y7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mrpl47Q8K2Y7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mrpl47Q8K2Y7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mrpl47Q8K2Y7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Mrpl47Q8K2Y7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mrpl47Q8K2Y7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mrpl47Q8K2Y7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mrpl47Q8K2Y7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mrpl47Q8K2Y7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mrpl47Q8K2Y7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mrpl47Q8K2Y7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mrpl47Q8K2Y7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mrpl47Q8K2Y7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mrpl47Q8K2Y7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mrpl47Q8K2Y7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mrpl47Q8K2Y7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mrpl47Q8K2Y7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms