Protein–RNA interactions for Protein: Q8K285

Fcho1, F-BAR domain only protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcho1Q8K285 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Fcho1Q8K285 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fcho1Q8K285 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Fcho1Q8K285 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fcho1Q8K285 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fcho1Q8K285 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fcho1Q8K285 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fcho1Q8K285 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fcho1Q8K285 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fcho1Q8K285 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fcho1Q8K285 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fcho1Q8K285 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fcho1Q8K285 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fcho1Q8K285 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fcho1Q8K285 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fcho1Q8K285 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fcho1Q8K285 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fcho1Q8K285 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fcho1Q8K285 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fcho1Q8K285 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fcho1Q8K285 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fcho1Q8K285 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fcho1Q8K285 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fcho1Q8K285 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fcho1Q8K285 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fcho1Q8K285 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fcho1Q8K285 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fcho1Q8K285 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fcho1Q8K285 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fcho1Q8K285 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fcho1Q8K285 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fcho1Q8K285 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fcho1Q8K285 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fcho1Q8K285 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fcho1Q8K285 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Fcho1Q8K285 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fcho1Q8K285 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fcho1Q8K285 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fcho1Q8K285 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fcho1Q8K285 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fcho1Q8K285 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fcho1Q8K285 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fcho1Q8K285 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fcho1Q8K285 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fcho1Q8K285 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fcho1Q8K285 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fcho1Q8K285 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fcho1Q8K285 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fcho1Q8K285 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fcho1Q8K285 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fcho1Q8K285 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fcho1Q8K285 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fcho1Q8K285 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fcho1Q8K285 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fcho1Q8K285 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fcho1Q8K285 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fcho1Q8K285 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fcho1Q8K285 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fcho1Q8K285 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fcho1Q8K285 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fcho1Q8K285 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fcho1Q8K285 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fcho1Q8K285 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fcho1Q8K285 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fcho1Q8K285 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fcho1Q8K285 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fcho1Q8K285 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fcho1Q8K285 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fcho1Q8K285 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fcho1Q8K285 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fcho1Q8K285 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Fcho1Q8K285 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fcho1Q8K285 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fcho1Q8K285 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fcho1Q8K285 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fcho1Q8K285 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fcho1Q8K285 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fcho1Q8K285 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fcho1Q8K285 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fcho1Q8K285 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fcho1Q8K285 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Fcho1Q8K285 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fcho1Q8K285 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fcho1Q8K285 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fcho1Q8K285 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fcho1Q8K285 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fcho1Q8K285 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Fcho1Q8K285 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fcho1Q8K285 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fcho1Q8K285 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fcho1Q8K285 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Fcho1Q8K285 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fcho1Q8K285 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fcho1Q8K285 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fcho1Q8K285 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fcho1Q8K285 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fcho1Q8K285 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Fcho1Q8K285 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fcho1Q8K285 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Fcho1Q8K285 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
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