Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

Predictions only

Length 984 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nek9Q8K1R7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nek9Q8K1R7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nek9Q8K1R7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nek9Q8K1R7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Nek9Q8K1R7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nek9Q8K1R7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nek9Q8K1R7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nek9Q8K1R7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nek9Q8K1R7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nek9Q8K1R7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nek9Q8K1R7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nek9Q8K1R7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nek9Q8K1R7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Nek9Q8K1R7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Nek9Q8K1R7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Nek9Q8K1R7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nek9Q8K1R7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nek9Q8K1R7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nek9Q8K1R7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nek9Q8K1R7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Nek9Q8K1R7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nek9Q8K1R7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Nek9Q8K1R7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Nek9Q8K1R7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Nek9Q8K1R7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nek9Q8K1R7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nek9Q8K1R7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nek9Q8K1R7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nek9Q8K1R7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Nek9Q8K1R7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nek9Q8K1R7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nek9Q8K1R7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nek9Q8K1R7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nek9Q8K1R7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Nek9Q8K1R7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Nek9Q8K1R7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Nek9Q8K1R7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Nek9Q8K1R7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Nek9Q8K1R7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Nek9Q8K1R7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Nek9Q8K1R7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Nek9Q8K1R7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Nek9Q8K1R7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Nek9Q8K1R7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Nek9Q8K1R7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Nek9Q8K1R7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Nek9Q8K1R7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Nek9Q8K1R7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Nek9Q8K1R7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Nek9Q8K1R7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Nek9Q8K1R7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Nek9Q8K1R7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Nek9Q8K1R7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Nek9Q8K1R7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Nek9Q8K1R7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nek9Q8K1R7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nek9Q8K1R7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nek9Q8K1R7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Nek9Q8K1R7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Nek9Q8K1R7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Nek9Q8K1R7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nek9Q8K1R7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nek9Q8K1R7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Nek9Q8K1R7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nek9Q8K1R7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nek9Q8K1R7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nek9Q8K1R7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nek9Q8K1R7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nek9Q8K1R7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nek9Q8K1R7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nek9Q8K1R7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Nek9Q8K1R7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Nek9Q8K1R7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nek9Q8K1R7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Nek9Q8K1R7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Nek9Q8K1R7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nek9Q8K1R7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nek9Q8K1R7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nek9Q8K1R7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nek9Q8K1R7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nek9Q8K1R7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nek9Q8K1R7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nek9Q8K1R7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Nek9Q8K1R7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Nek9Q8K1R7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nek9Q8K1R7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nek9Q8K1R7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nek9Q8K1R7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nek9Q8K1R7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nek9Q8K1R7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nek9Q8K1R7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nek9Q8K1R7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nek9Q8K1R7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nek9Q8K1R7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nek9Q8K1R7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nek9Q8K1R7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Nek9Q8K1R7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Nek9Q8K1R7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Nek9Q8K1R7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.5 ms