Protein–RNA interactions for Protein: Q8K003

Tma7, Translation machinery-associated protein 7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 64 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tma7Q8K003 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tma7Q8K003 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tma7Q8K003 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Tma7Q8K003 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tma7Q8K003 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tma7Q8K003 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tma7Q8K003 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tma7Q8K003 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tma7Q8K003 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tma7Q8K003 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Tma7Q8K003 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tma7Q8K003 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tma7Q8K003 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tma7Q8K003 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tma7Q8K003 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tma7Q8K003 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tma7Q8K003 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tma7Q8K003 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tma7Q8K003 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tma7Q8K003 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tma7Q8K003 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Tma7Q8K003 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tma7Q8K003 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tma7Q8K003 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tma7Q8K003 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tma7Q8K003 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tma7Q8K003 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tma7Q8K003 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tma7Q8K003 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tma7Q8K003 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tma7Q8K003 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tma7Q8K003 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tma7Q8K003 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tma7Q8K003 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tma7Q8K003 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tma7Q8K003 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tma7Q8K003 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tma7Q8K003 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tma7Q8K003 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tma7Q8K003 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tma7Q8K003 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tma7Q8K003 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tma7Q8K003 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tma7Q8K003 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tma7Q8K003 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tma7Q8K003 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tma7Q8K003 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tma7Q8K003 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tma7Q8K003 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tma7Q8K003 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tma7Q8K003 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tma7Q8K003 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tma7Q8K003 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tma7Q8K003 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tma7Q8K003 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tma7Q8K003 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tma7Q8K003 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tma7Q8K003 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tma7Q8K003 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tma7Q8K003 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tma7Q8K003 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tma7Q8K003 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Tma7Q8K003 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tma7Q8K003 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tma7Q8K003 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tma7Q8K003 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tma7Q8K003 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tma7Q8K003 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tma7Q8K003 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tma7Q8K003 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tma7Q8K003 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tma7Q8K003 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tma7Q8K003 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tma7Q8K003 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tma7Q8K003 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tma7Q8K003 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tma7Q8K003 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tma7Q8K003 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tma7Q8K003 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tma7Q8K003 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tma7Q8K003 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tma7Q8K003 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tma7Q8K003 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tma7Q8K003 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tma7Q8K003 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tma7Q8K003 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tma7Q8K003 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tma7Q8K003 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tma7Q8K003 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tma7Q8K003 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tma7Q8K003 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tma7Q8K003 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tma7Q8K003 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tma7Q8K003 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tma7Q8K003 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tma7Q8K003 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tma7Q8K003 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tma7Q8K003 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tma7Q8K003 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tma7Q8K003 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms