Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW4

Cpne5, Copine-5, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne5Q8JZW4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cpne5Q8JZW4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cpne5Q8JZW4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cpne5Q8JZW4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cpne5Q8JZW4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cpne5Q8JZW4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cpne5Q8JZW4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Cpne5Q8JZW4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cpne5Q8JZW4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cpne5Q8JZW4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cpne5Q8JZW4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cpne5Q8JZW4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cpne5Q8JZW4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cpne5Q8JZW4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cpne5Q8JZW4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cpne5Q8JZW4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cpne5Q8JZW4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cpne5Q8JZW4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cpne5Q8JZW4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cpne5Q8JZW4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cpne5Q8JZW4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cpne5Q8JZW4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cpne5Q8JZW4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cpne5Q8JZW4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cpne5Q8JZW4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cpne5Q8JZW4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cpne5Q8JZW4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cpne5Q8JZW4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cpne5Q8JZW4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cpne5Q8JZW4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cpne5Q8JZW4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cpne5Q8JZW4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cpne5Q8JZW4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cpne5Q8JZW4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cpne5Q8JZW4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cpne5Q8JZW4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cpne5Q8JZW4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cpne5Q8JZW4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cpne5Q8JZW4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cpne5Q8JZW4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cpne5Q8JZW4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cpne5Q8JZW4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cpne5Q8JZW4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cpne5Q8JZW4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cpne5Q8JZW4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cpne5Q8JZW4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cpne5Q8JZW4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cpne5Q8JZW4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cpne5Q8JZW4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cpne5Q8JZW4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cpne5Q8JZW4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cpne5Q8JZW4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cpne5Q8JZW4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cpne5Q8JZW4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cpne5Q8JZW4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cpne5Q8JZW4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cpne5Q8JZW4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cpne5Q8JZW4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cpne5Q8JZW4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cpne5Q8JZW4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cpne5Q8JZW4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cpne5Q8JZW4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cpne5Q8JZW4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cpne5Q8JZW4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cpne5Q8JZW4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cpne5Q8JZW4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cpne5Q8JZW4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cpne5Q8JZW4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cpne5Q8JZW4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cpne5Q8JZW4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cpne5Q8JZW4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cpne5Q8JZW4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cpne5Q8JZW4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cpne5Q8JZW4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cpne5Q8JZW4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cpne5Q8JZW4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cpne5Q8JZW4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Cpne5Q8JZW4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cpne5Q8JZW4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cpne5Q8JZW4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cpne5Q8JZW4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cpne5Q8JZW4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cpne5Q8JZW4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cpne5Q8JZW4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cpne5Q8JZW4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cpne5Q8JZW4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Cpne5Q8JZW4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cpne5Q8JZW4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cpne5Q8JZW4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cpne5Q8JZW4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cpne5Q8JZW4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cpne5Q8JZW4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cpne5Q8JZW4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cpne5Q8JZW4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cpne5Q8JZW4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cpne5Q8JZW4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cpne5Q8JZW4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cpne5Q8JZW4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cpne5Q8JZW4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cpne5Q8JZW4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms