Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIW5

Twnk, Twinkle protein, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwnkQ8CIW5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TwnkQ8CIW5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TwnkQ8CIW5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TwnkQ8CIW5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TwnkQ8CIW5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TwnkQ8CIW5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TwnkQ8CIW5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TwnkQ8CIW5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TwnkQ8CIW5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TwnkQ8CIW5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TwnkQ8CIW5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TwnkQ8CIW5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TwnkQ8CIW5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TwnkQ8CIW5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TwnkQ8CIW5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TwnkQ8CIW5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TwnkQ8CIW5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TwnkQ8CIW5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TwnkQ8CIW5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TwnkQ8CIW5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TwnkQ8CIW5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TwnkQ8CIW5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TwnkQ8CIW5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TwnkQ8CIW5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TwnkQ8CIW5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TwnkQ8CIW5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TwnkQ8CIW5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TwnkQ8CIW5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TwnkQ8CIW5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TwnkQ8CIW5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TwnkQ8CIW5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TwnkQ8CIW5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TwnkQ8CIW5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TwnkQ8CIW5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TwnkQ8CIW5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TwnkQ8CIW5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TwnkQ8CIW5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TwnkQ8CIW5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TwnkQ8CIW5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TwnkQ8CIW5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TwnkQ8CIW5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TwnkQ8CIW5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TwnkQ8CIW5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TwnkQ8CIW5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TwnkQ8CIW5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TwnkQ8CIW5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TwnkQ8CIW5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TwnkQ8CIW5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TwnkQ8CIW5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TwnkQ8CIW5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TwnkQ8CIW5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TwnkQ8CIW5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TwnkQ8CIW5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TwnkQ8CIW5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TwnkQ8CIW5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TwnkQ8CIW5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TwnkQ8CIW5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TwnkQ8CIW5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TwnkQ8CIW5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TwnkQ8CIW5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TwnkQ8CIW5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TwnkQ8CIW5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TwnkQ8CIW5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TwnkQ8CIW5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TwnkQ8CIW5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TwnkQ8CIW5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TwnkQ8CIW5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TwnkQ8CIW5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TwnkQ8CIW5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TwnkQ8CIW5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TwnkQ8CIW5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TwnkQ8CIW5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TwnkQ8CIW5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TwnkQ8CIW5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TwnkQ8CIW5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TwnkQ8CIW5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TwnkQ8CIW5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TwnkQ8CIW5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TwnkQ8CIW5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TwnkQ8CIW5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TwnkQ8CIW5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TwnkQ8CIW5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TwnkQ8CIW5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TwnkQ8CIW5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TwnkQ8CIW5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TwnkQ8CIW5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TwnkQ8CIW5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TwnkQ8CIW5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TwnkQ8CIW5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TwnkQ8CIW5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TwnkQ8CIW5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TwnkQ8CIW5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TwnkQ8CIW5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TwnkQ8CIW5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TwnkQ8CIW5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TwnkQ8CIW5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TwnkQ8CIW5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TwnkQ8CIW5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TwnkQ8CIW5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TwnkQ8CIW5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms