Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIM1

Lrrc45, Leucine-rich repeat-containing protein 45, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc45Q8CIM1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lrrc45Q8CIM1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lrrc45Q8CIM1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lrrc45Q8CIM1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Lrrc45Q8CIM1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Lrrc45Q8CIM1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lrrc45Q8CIM1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lrrc45Q8CIM1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Lrrc45Q8CIM1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lrrc45Q8CIM1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lrrc45Q8CIM1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lrrc45Q8CIM1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lrrc45Q8CIM1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lrrc45Q8CIM1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lrrc45Q8CIM1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lrrc45Q8CIM1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lrrc45Q8CIM1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lrrc45Q8CIM1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Lrrc45Q8CIM1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lrrc45Q8CIM1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lrrc45Q8CIM1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lrrc45Q8CIM1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lrrc45Q8CIM1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lrrc45Q8CIM1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lrrc45Q8CIM1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lrrc45Q8CIM1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lrrc45Q8CIM1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lrrc45Q8CIM1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lrrc45Q8CIM1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Lrrc45Q8CIM1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lrrc45Q8CIM1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lrrc45Q8CIM1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lrrc45Q8CIM1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lrrc45Q8CIM1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Lrrc45Q8CIM1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lrrc45Q8CIM1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lrrc45Q8CIM1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lrrc45Q8CIM1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lrrc45Q8CIM1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lrrc45Q8CIM1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lrrc45Q8CIM1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lrrc45Q8CIM1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lrrc45Q8CIM1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lrrc45Q8CIM1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lrrc45Q8CIM1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lrrc45Q8CIM1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lrrc45Q8CIM1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lrrc45Q8CIM1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Lrrc45Q8CIM1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lrrc45Q8CIM1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lrrc45Q8CIM1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lrrc45Q8CIM1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lrrc45Q8CIM1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lrrc45Q8CIM1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lrrc45Q8CIM1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lrrc45Q8CIM1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lrrc45Q8CIM1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lrrc45Q8CIM1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lrrc45Q8CIM1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lrrc45Q8CIM1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lrrc45Q8CIM1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Lrrc45Q8CIM1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lrrc45Q8CIM1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lrrc45Q8CIM1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lrrc45Q8CIM1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lrrc45Q8CIM1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lrrc45Q8CIM1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lrrc45Q8CIM1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lrrc45Q8CIM1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lrrc45Q8CIM1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lrrc45Q8CIM1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lrrc45Q8CIM1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lrrc45Q8CIM1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lrrc45Q8CIM1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lrrc45Q8CIM1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lrrc45Q8CIM1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lrrc45Q8CIM1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lrrc45Q8CIM1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lrrc45Q8CIM1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lrrc45Q8CIM1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lrrc45Q8CIM1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lrrc45Q8CIM1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lrrc45Q8CIM1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lrrc45Q8CIM1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lrrc45Q8CIM1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lrrc45Q8CIM1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lrrc45Q8CIM1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Lrrc45Q8CIM1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lrrc45Q8CIM1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lrrc45Q8CIM1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lrrc45Q8CIM1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lrrc45Q8CIM1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lrrc45Q8CIM1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lrrc45Q8CIM1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lrrc45Q8CIM1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lrrc45Q8CIM1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lrrc45Q8CIM1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lrrc45Q8CIM1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lrrc45Q8CIM1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lrrc45Q8CIM1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms