Protein–RNA interactions for Protein: Q8CII0

Zbtb8b, Zinc finger and BTB domain-containing protein 8B, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb8bQ8CII0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zbtb8bQ8CII0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zbtb8bQ8CII0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zbtb8bQ8CII0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zbtb8bQ8CII0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zbtb8bQ8CII0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zbtb8bQ8CII0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zbtb8bQ8CII0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zbtb8bQ8CII0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zbtb8bQ8CII0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zbtb8bQ8CII0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zbtb8bQ8CII0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zbtb8bQ8CII0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zbtb8bQ8CII0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zbtb8bQ8CII0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zbtb8bQ8CII0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zbtb8bQ8CII0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zbtb8bQ8CII0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zbtb8bQ8CII0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zbtb8bQ8CII0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zbtb8bQ8CII0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zbtb8bQ8CII0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zbtb8bQ8CII0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zbtb8bQ8CII0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zbtb8bQ8CII0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zbtb8bQ8CII0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zbtb8bQ8CII0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Zbtb8bQ8CII0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zbtb8bQ8CII0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zbtb8bQ8CII0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zbtb8bQ8CII0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zbtb8bQ8CII0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zbtb8bQ8CII0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zbtb8bQ8CII0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zbtb8bQ8CII0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Zbtb8bQ8CII0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Zbtb8bQ8CII0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Zbtb8bQ8CII0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zbtb8bQ8CII0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zbtb8bQ8CII0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zbtb8bQ8CII0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zbtb8bQ8CII0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zbtb8bQ8CII0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zbtb8bQ8CII0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zbtb8bQ8CII0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zbtb8bQ8CII0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zbtb8bQ8CII0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zbtb8bQ8CII0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zbtb8bQ8CII0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zbtb8bQ8CII0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zbtb8bQ8CII0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zbtb8bQ8CII0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zbtb8bQ8CII0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zbtb8bQ8CII0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zbtb8bQ8CII0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zbtb8bQ8CII0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zbtb8bQ8CII0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zbtb8bQ8CII0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zbtb8bQ8CII0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zbtb8bQ8CII0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zbtb8bQ8CII0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zbtb8bQ8CII0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zbtb8bQ8CII0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zbtb8bQ8CII0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zbtb8bQ8CII0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zbtb8bQ8CII0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zbtb8bQ8CII0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zbtb8bQ8CII0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zbtb8bQ8CII0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zbtb8bQ8CII0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zbtb8bQ8CII0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zbtb8bQ8CII0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zbtb8bQ8CII0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zbtb8bQ8CII0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Zbtb8bQ8CII0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zbtb8bQ8CII0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zbtb8bQ8CII0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Zbtb8bQ8CII0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zbtb8bQ8CII0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zbtb8bQ8CII0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Zbtb8bQ8CII0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Zbtb8bQ8CII0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zbtb8bQ8CII0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zbtb8bQ8CII0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zbtb8bQ8CII0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zbtb8bQ8CII0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zbtb8bQ8CII0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zbtb8bQ8CII0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zbtb8bQ8CII0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zbtb8bQ8CII0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zbtb8bQ8CII0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zbtb8bQ8CII0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zbtb8bQ8CII0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zbtb8bQ8CII0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Zbtb8bQ8CII0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zbtb8bQ8CII0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zbtb8bQ8CII0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zbtb8bQ8CII0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zbtb8bQ8CII0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zbtb8bQ8CII0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms