Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIE6

Copa, Coatomer subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopaQ8CIE6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CopaQ8CIE6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CopaQ8CIE6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CopaQ8CIE6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CopaQ8CIE6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CopaQ8CIE6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CopaQ8CIE6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CopaQ8CIE6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CopaQ8CIE6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CopaQ8CIE6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CopaQ8CIE6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CopaQ8CIE6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CopaQ8CIE6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CopaQ8CIE6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CopaQ8CIE6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CopaQ8CIE6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CopaQ8CIE6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CopaQ8CIE6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CopaQ8CIE6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CopaQ8CIE6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CopaQ8CIE6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CopaQ8CIE6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CopaQ8CIE6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CopaQ8CIE6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CopaQ8CIE6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CopaQ8CIE6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CopaQ8CIE6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CopaQ8CIE6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CopaQ8CIE6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CopaQ8CIE6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CopaQ8CIE6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CopaQ8CIE6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CopaQ8CIE6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CopaQ8CIE6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CopaQ8CIE6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CopaQ8CIE6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CopaQ8CIE6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CopaQ8CIE6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CopaQ8CIE6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CopaQ8CIE6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CopaQ8CIE6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CopaQ8CIE6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CopaQ8CIE6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CopaQ8CIE6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CopaQ8CIE6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CopaQ8CIE6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CopaQ8CIE6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CopaQ8CIE6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CopaQ8CIE6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CopaQ8CIE6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CopaQ8CIE6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CopaQ8CIE6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CopaQ8CIE6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CopaQ8CIE6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CopaQ8CIE6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CopaQ8CIE6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CopaQ8CIE6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CopaQ8CIE6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CopaQ8CIE6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CopaQ8CIE6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CopaQ8CIE6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CopaQ8CIE6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CopaQ8CIE6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CopaQ8CIE6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CopaQ8CIE6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CopaQ8CIE6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CopaQ8CIE6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CopaQ8CIE6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CopaQ8CIE6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
CopaQ8CIE6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CopaQ8CIE6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CopaQ8CIE6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CopaQ8CIE6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CopaQ8CIE6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CopaQ8CIE6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CopaQ8CIE6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CopaQ8CIE6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CopaQ8CIE6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CopaQ8CIE6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CopaQ8CIE6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CopaQ8CIE6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CopaQ8CIE6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CopaQ8CIE6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CopaQ8CIE6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CopaQ8CIE6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CopaQ8CIE6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CopaQ8CIE6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CopaQ8CIE6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CopaQ8CIE6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CopaQ8CIE6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CopaQ8CIE6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CopaQ8CIE6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CopaQ8CIE6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CopaQ8CIE6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CopaQ8CIE6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CopaQ8CIE6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CopaQ8CIE6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CopaQ8CIE6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CopaQ8CIE6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CopaQ8CIE6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms