Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFW7

Cc2d2a, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cc2d2aQ8CFW7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43,33■■■■■ 4,53
Cc2d2aQ8CFW7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,33■■■■■ 4,53
Cc2d2aQ8CFW7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,33■■■■■ 4,53
Cc2d2aQ8CFW7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC43,32■■■■■ 4,53
Cc2d2aQ8CFW7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC43,31■■■■■ 4,52
Cc2d2aQ8CFW7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,31■■■■■ 4,52
Cc2d2aQ8CFW7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC43,3■■■■■ 4,52
Cc2d2aQ8CFW7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,3■■■■■ 4,52
Cc2d2aQ8CFW7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC43,29■■■■■ 4,52
Cc2d2aQ8CFW7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,27■■■■■ 4,52
Cc2d2aQ8CFW7 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,27■■■■■ 4,52
Cc2d2aQ8CFW7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,26■■■■■ 4,52
Cc2d2aQ8CFW7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC43,26■■■■■ 4,52
Cc2d2aQ8CFW7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43,25■■■■■ 4,51
Cc2d2aQ8CFW7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC43,25■■■■■ 4,51
Cc2d2aQ8CFW7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC43,24■■■■■ 4,51
Cc2d2aQ8CFW7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC43,22■■■■■ 4,51
Cc2d2aQ8CFW7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC43,2■■■■■ 4,51
Cc2d2aQ8CFW7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,18■■■■■ 4,5
Cc2d2aQ8CFW7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC43,18■■■■■ 4,5
Cc2d2aQ8CFW7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC43,18■■■■■ 4,5
Cc2d2aQ8CFW7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC43,17■■■■■ 4,5
Cc2d2aQ8CFW7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,16■■■■■ 4,5
Cc2d2aQ8CFW7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,16■■■■■ 4,5
Cc2d2aQ8CFW7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,16■■■■■ 4,5
Cc2d2aQ8CFW7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC43,16■■■■■ 4,5
Cc2d2aQ8CFW7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC43,16■■■■■ 4,5
Cc2d2aQ8CFW7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,15■■■■■ 4,5
Cc2d2aQ8CFW7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43,15■■■■■ 4,5
Cc2d2aQ8CFW7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,13■■■■■ 4,49
Cc2d2aQ8CFW7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43,11■■■■■ 4,49
Cc2d2aQ8CFW7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC43,1■■■■■ 4,49
Cc2d2aQ8CFW7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC43,09■■■■■ 4,49
Cc2d2aQ8CFW7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC43,08■■■■■ 4,49
Cc2d2aQ8CFW7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC43,08■■■■■ 4,49
Cc2d2aQ8CFW7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC43,08■■■■■ 4,49
Cc2d2aQ8CFW7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43,07■■■■■ 4,49
Cc2d2aQ8CFW7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC43,04■■■■■ 4,48
Cc2d2aQ8CFW7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,02■■■■■ 4,48
Cc2d2aQ8CFW7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC43,01■■■■■ 4,48
Cc2d2aQ8CFW7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43■■■■■ 4,47
Cc2d2aQ8CFW7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC42,99■■■■■ 4,47
Cc2d2aQ8CFW7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,99■■■■■ 4,47
Cc2d2aQ8CFW7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,96■■■■■ 4,47
Cc2d2aQ8CFW7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,96■■■■■ 4,47
Cc2d2aQ8CFW7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,96■■■■■ 4,47
Cc2d2aQ8CFW7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,95■■■■■ 4,47
Cc2d2aQ8CFW7 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,95■■■■■ 4,47
Cc2d2aQ8CFW7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC42,93■■■■■ 4,46
Cc2d2aQ8CFW7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42,93■■■■■ 4,46
Cc2d2aQ8CFW7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC42,93■■■■■ 4,46
Cc2d2aQ8CFW7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC42,9■■■■■ 4,46
Cc2d2aQ8CFW7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,9■■■■■ 4,46
Cc2d2aQ8CFW7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC42,89■■■■■ 4,46
Cc2d2aQ8CFW7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42,88■■■■■ 4,46
Cc2d2aQ8CFW7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC42,88■■■■■ 4,45
Cc2d2aQ8CFW7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC42,87■■■■■ 4,45
Cc2d2aQ8CFW7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42,87■■■■■ 4,45
Cc2d2aQ8CFW7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC42,87■■■■■ 4,45
Cc2d2aQ8CFW7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC42,86■■■■■ 4,45
Cc2d2aQ8CFW7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,86■■■■■ 4,45
Cc2d2aQ8CFW7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC42,85■■■■■ 4,45
Cc2d2aQ8CFW7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,85■■■■■ 4,45
Cc2d2aQ8CFW7 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC42,84■■■■■ 4,45
Cc2d2aQ8CFW7 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC42,84■■■■■ 4,45
Cc2d2aQ8CFW7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC42,84■■■■■ 4,45
Cc2d2aQ8CFW7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,83■■■■■ 4,45
Cc2d2aQ8CFW7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,82■■■■■ 4,45
Cc2d2aQ8CFW7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC42,82■■■■■ 4,44
Cc2d2aQ8CFW7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42,82■■■■■ 4,44
Cc2d2aQ8CFW7 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,81■■■■■ 4,44
Cc2d2aQ8CFW7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC42,81■■■■■ 4,44
Cc2d2aQ8CFW7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42,81■■■■■ 4,44
Cc2d2aQ8CFW7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42,81■■■■■ 4,44
Cc2d2aQ8CFW7 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC42,81■■■■■ 4,44
Cc2d2aQ8CFW7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,79■■■■■ 4,44
Cc2d2aQ8CFW7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC42,75■■■■■ 4,43
Cc2d2aQ8CFW7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,73■■■■■ 4,43
Cc2d2aQ8CFW7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC42,73■■■■■ 4,43
Cc2d2aQ8CFW7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC42,71■■■■■ 4,43
Cc2d2aQ8CFW7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,71■■■■■ 4,43
Cc2d2aQ8CFW7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42,71■■■■■ 4,43
Cc2d2aQ8CFW7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC42,69■■■■■ 4,42
Cc2d2aQ8CFW7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,69■■■■■ 4,42
Cc2d2aQ8CFW7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC42,68■■■■■ 4,42
Cc2d2aQ8CFW7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC42,68■■■■■ 4,42
Cc2d2aQ8CFW7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC42,67■■■■■ 4,42
Cc2d2aQ8CFW7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,64■■■■■ 4,42
Cc2d2aQ8CFW7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,64■■■■■ 4,42
Cc2d2aQ8CFW7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC42,64■■■■■ 4,42
Cc2d2aQ8CFW7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC42,63■■■■■ 4,41
Cc2d2aQ8CFW7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC42,63■■■■■ 4,41
Cc2d2aQ8CFW7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,62■■■■■ 4,41
Cc2d2aQ8CFW7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC42,62■■■■■ 4,41
Cc2d2aQ8CFW7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC42,62■■■■■ 4,41
Cc2d2aQ8CFW7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,62■■■■■ 4,41
Cc2d2aQ8CFW7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42,6■■■■■ 4,41
Cc2d2aQ8CFW7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42,6■■■■■ 4,41
Cc2d2aQ8CFW7 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,6■■■■■ 4,41
Cc2d2aQ8CFW7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42,6■■■■■ 4,41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19,9 ms