Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc17Q8CE13 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc17Q8CE13 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc17Q8CE13 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc17Q8CE13 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc17Q8CE13 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc17Q8CE13 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc17Q8CE13 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc17Q8CE13 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc17Q8CE13 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc17Q8CE13 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc17Q8CE13 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc17Q8CE13 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc17Q8CE13 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc17Q8CE13 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc17Q8CE13 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc17Q8CE13 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc17Q8CE13 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc17Q8CE13 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc17Q8CE13 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc17Q8CE13 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc17Q8CE13 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc17Q8CE13 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ccdc17Q8CE13 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc17Q8CE13 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc17Q8CE13 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc17Q8CE13 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc17Q8CE13 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc17Q8CE13 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc17Q8CE13 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc17Q8CE13 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc17Q8CE13 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc17Q8CE13 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc17Q8CE13 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc17Q8CE13 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc17Q8CE13 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc17Q8CE13 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc17Q8CE13 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc17Q8CE13 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc17Q8CE13 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc17Q8CE13 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc17Q8CE13 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc17Q8CE13 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc17Q8CE13 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc17Q8CE13 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc17Q8CE13 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc17Q8CE13 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc17Q8CE13 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc17Q8CE13 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc17Q8CE13 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc17Q8CE13 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc17Q8CE13 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc17Q8CE13 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc17Q8CE13 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc17Q8CE13 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc17Q8CE13 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc17Q8CE13 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc17Q8CE13 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc17Q8CE13 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc17Q8CE13 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc17Q8CE13 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc17Q8CE13 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc17Q8CE13 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc17Q8CE13 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc17Q8CE13 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc17Q8CE13 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc17Q8CE13 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc17Q8CE13 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc17Q8CE13 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc17Q8CE13 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc17Q8CE13 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc17Q8CE13 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc17Q8CE13 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc17Q8CE13 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc17Q8CE13 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc17Q8CE13 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc17Q8CE13 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc17Q8CE13 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc17Q8CE13 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc17Q8CE13 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc17Q8CE13 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc17Q8CE13 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc17Q8CE13 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc17Q8CE13 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc17Q8CE13 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc17Q8CE13 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc17Q8CE13 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc17Q8CE13 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc17Q8CE13 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc17Q8CE13 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc17Q8CE13 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc17Q8CE13 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc17Q8CE13 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc17Q8CE13 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc17Q8CE13 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc17Q8CE13 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc17Q8CE13 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc17Q8CE13 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc17Q8CE13 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc17Q8CE13 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.5 ms