Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDU4

Fbxl13, F-box/LRR-repeat protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxl13Q8CDU4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fbxl13Q8CDU4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fbxl13Q8CDU4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fbxl13Q8CDU4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fbxl13Q8CDU4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fbxl13Q8CDU4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fbxl13Q8CDU4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fbxl13Q8CDU4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fbxl13Q8CDU4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fbxl13Q8CDU4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fbxl13Q8CDU4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fbxl13Q8CDU4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Fbxl13Q8CDU4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Fbxl13Q8CDU4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Fbxl13Q8CDU4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fbxl13Q8CDU4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fbxl13Q8CDU4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fbxl13Q8CDU4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fbxl13Q8CDU4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fbxl13Q8CDU4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fbxl13Q8CDU4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fbxl13Q8CDU4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fbxl13Q8CDU4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fbxl13Q8CDU4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fbxl13Q8CDU4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fbxl13Q8CDU4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fbxl13Q8CDU4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fbxl13Q8CDU4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fbxl13Q8CDU4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fbxl13Q8CDU4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fbxl13Q8CDU4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fbxl13Q8CDU4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fbxl13Q8CDU4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fbxl13Q8CDU4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Fbxl13Q8CDU4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fbxl13Q8CDU4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fbxl13Q8CDU4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fbxl13Q8CDU4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fbxl13Q8CDU4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Fbxl13Q8CDU4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Fbxl13Q8CDU4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fbxl13Q8CDU4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fbxl13Q8CDU4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fbxl13Q8CDU4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fbxl13Q8CDU4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fbxl13Q8CDU4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fbxl13Q8CDU4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fbxl13Q8CDU4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fbxl13Q8CDU4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fbxl13Q8CDU4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fbxl13Q8CDU4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fbxl13Q8CDU4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fbxl13Q8CDU4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fbxl13Q8CDU4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fbxl13Q8CDU4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fbxl13Q8CDU4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fbxl13Q8CDU4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fbxl13Q8CDU4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fbxl13Q8CDU4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fbxl13Q8CDU4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fbxl13Q8CDU4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fbxl13Q8CDU4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fbxl13Q8CDU4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Fbxl13Q8CDU4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fbxl13Q8CDU4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fbxl13Q8CDU4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fbxl13Q8CDU4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Fbxl13Q8CDU4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fbxl13Q8CDU4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fbxl13Q8CDU4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fbxl13Q8CDU4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Fbxl13Q8CDU4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Fbxl13Q8CDU4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Fbxl13Q8CDU4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Fbxl13Q8CDU4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fbxl13Q8CDU4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fbxl13Q8CDU4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fbxl13Q8CDU4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fbxl13Q8CDU4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fbxl13Q8CDU4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fbxl13Q8CDU4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fbxl13Q8CDU4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Fbxl13Q8CDU4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fbxl13Q8CDU4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fbxl13Q8CDU4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fbxl13Q8CDU4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fbxl13Q8CDU4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Fbxl13Q8CDU4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fbxl13Q8CDU4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fbxl13Q8CDU4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fbxl13Q8CDU4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fbxl13Q8CDU4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fbxl13Q8CDU4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fbxl13Q8CDU4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fbxl13Q8CDU4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fbxl13Q8CDU4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fbxl13Q8CDU4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fbxl13Q8CDU4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fbxl13Q8CDU4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fbxl13Q8CDU4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms