Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc87Q8CDL9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc87Q8CDL9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc87Q8CDL9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc87Q8CDL9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc87Q8CDL9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc87Q8CDL9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc87Q8CDL9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc87Q8CDL9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc87Q8CDL9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc87Q8CDL9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc87Q8CDL9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc87Q8CDL9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc87Q8CDL9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ccdc87Q8CDL9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc87Q8CDL9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc87Q8CDL9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc87Q8CDL9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc87Q8CDL9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc87Q8CDL9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc87Q8CDL9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc87Q8CDL9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc87Q8CDL9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc87Q8CDL9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc87Q8CDL9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc87Q8CDL9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc87Q8CDL9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc87Q8CDL9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc87Q8CDL9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc87Q8CDL9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc87Q8CDL9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccdc87Q8CDL9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc87Q8CDL9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc87Q8CDL9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc87Q8CDL9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc87Q8CDL9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc87Q8CDL9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc87Q8CDL9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc87Q8CDL9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc87Q8CDL9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc87Q8CDL9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc87Q8CDL9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc87Q8CDL9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc87Q8CDL9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc87Q8CDL9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc87Q8CDL9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc87Q8CDL9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc87Q8CDL9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc87Q8CDL9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc87Q8CDL9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc87Q8CDL9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc87Q8CDL9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc87Q8CDL9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc87Q8CDL9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc87Q8CDL9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc87Q8CDL9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc87Q8CDL9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc87Q8CDL9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc87Q8CDL9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc87Q8CDL9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc87Q8CDL9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc87Q8CDL9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc87Q8CDL9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc87Q8CDL9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc87Q8CDL9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc87Q8CDL9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc87Q8CDL9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc87Q8CDL9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc87Q8CDL9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc87Q8CDL9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc87Q8CDL9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc87Q8CDL9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc87Q8CDL9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc87Q8CDL9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc87Q8CDL9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc87Q8CDL9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc87Q8CDL9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc87Q8CDL9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc87Q8CDL9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc87Q8CDL9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ccdc87Q8CDL9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc87Q8CDL9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc87Q8CDL9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc87Q8CDL9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc87Q8CDL9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc87Q8CDL9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc87Q8CDL9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc87Q8CDL9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc87Q8CDL9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc87Q8CDL9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc87Q8CDL9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc87Q8CDL9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc87Q8CDL9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc87Q8CDL9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc87Q8CDL9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc87Q8CDL9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc87Q8CDL9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc87Q8CDL9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc87Q8CDL9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc87Q8CDL9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 156.4 ms