Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCJ9

Phf20l1, PHD finger protein 20-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,013 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf20l1Q8CCJ9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
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Phf20l1Q8CCJ9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Phf20l1Q8CCJ9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
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Phf20l1Q8CCJ9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
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Phf20l1Q8CCJ9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
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Phf20l1Q8CCJ9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
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Phf20l1Q8CCJ9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Phf20l1Q8CCJ9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
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Phf20l1Q8CCJ9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
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Phf20l1Q8CCJ9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Phf20l1Q8CCJ9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
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Phf20l1Q8CCJ9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
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Phf20l1Q8CCJ9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Phf20l1Q8CCJ9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
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Phf20l1Q8CCJ9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Phf20l1Q8CCJ9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Phf20l1Q8CCJ9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
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Phf20l1Q8CCJ9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
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Phf20l1Q8CCJ9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
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Phf20l1Q8CCJ9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
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Phf20l1Q8CCJ9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Phf20l1Q8CCJ9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Phf20l1Q8CCJ9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
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Phf20l1Q8CCJ9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Phf20l1Q8CCJ9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Phf20l1Q8CCJ9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Phf20l1Q8CCJ9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Phf20l1Q8CCJ9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Phf20l1Q8CCJ9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Phf20l1Q8CCJ9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Phf20l1Q8CCJ9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Phf20l1Q8CCJ9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Phf20l1Q8CCJ9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Phf20l1Q8CCJ9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Phf20l1Q8CCJ9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Phf20l1Q8CCJ9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Phf20l1Q8CCJ9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Phf20l1Q8CCJ9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Phf20l1Q8CCJ9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Phf20l1Q8CCJ9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Phf20l1Q8CCJ9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Phf20l1Q8CCJ9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Phf20l1Q8CCJ9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Phf20l1Q8CCJ9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Phf20l1Q8CCJ9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
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