Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nhlrc3Q8CCH2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nhlrc3Q8CCH2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nhlrc3Q8CCH2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nhlrc3Q8CCH2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nhlrc3Q8CCH2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nhlrc3Q8CCH2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nhlrc3Q8CCH2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nhlrc3Q8CCH2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Nhlrc3Q8CCH2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nhlrc3Q8CCH2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Nhlrc3Q8CCH2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nhlrc3Q8CCH2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nhlrc3Q8CCH2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Nhlrc3Q8CCH2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nhlrc3Q8CCH2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nhlrc3Q8CCH2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nhlrc3Q8CCH2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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