Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAT8

Fbxo48, F-box only protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo48Q8CAT8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fbxo48Q8CAT8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fbxo48Q8CAT8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fbxo48Q8CAT8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fbxo48Q8CAT8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fbxo48Q8CAT8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fbxo48Q8CAT8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fbxo48Q8CAT8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fbxo48Q8CAT8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fbxo48Q8CAT8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fbxo48Q8CAT8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fbxo48Q8CAT8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fbxo48Q8CAT8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Fbxo48Q8CAT8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fbxo48Q8CAT8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fbxo48Q8CAT8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fbxo48Q8CAT8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fbxo48Q8CAT8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Fbxo48Q8CAT8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Fbxo48Q8CAT8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Fbxo48Q8CAT8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fbxo48Q8CAT8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fbxo48Q8CAT8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fbxo48Q8CAT8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fbxo48Q8CAT8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fbxo48Q8CAT8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fbxo48Q8CAT8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fbxo48Q8CAT8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fbxo48Q8CAT8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fbxo48Q8CAT8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fbxo48Q8CAT8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Fbxo48Q8CAT8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Fbxo48Q8CAT8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Fbxo48Q8CAT8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Fbxo48Q8CAT8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fbxo48Q8CAT8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fbxo48Q8CAT8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fbxo48Q8CAT8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fbxo48Q8CAT8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fbxo48Q8CAT8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Fbxo48Q8CAT8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fbxo48Q8CAT8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fbxo48Q8CAT8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fbxo48Q8CAT8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fbxo48Q8CAT8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Fbxo48Q8CAT8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fbxo48Q8CAT8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fbxo48Q8CAT8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fbxo48Q8CAT8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fbxo48Q8CAT8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Fbxo48Q8CAT8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fbxo48Q8CAT8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fbxo48Q8CAT8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fbxo48Q8CAT8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fbxo48Q8CAT8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fbxo48Q8CAT8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fbxo48Q8CAT8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fbxo48Q8CAT8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fbxo48Q8CAT8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fbxo48Q8CAT8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fbxo48Q8CAT8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fbxo48Q8CAT8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fbxo48Q8CAT8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fbxo48Q8CAT8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fbxo48Q8CAT8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fbxo48Q8CAT8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fbxo48Q8CAT8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fbxo48Q8CAT8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fbxo48Q8CAT8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fbxo48Q8CAT8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Fbxo48Q8CAT8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fbxo48Q8CAT8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Fbxo48Q8CAT8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fbxo48Q8CAT8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fbxo48Q8CAT8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fbxo48Q8CAT8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fbxo48Q8CAT8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fbxo48Q8CAT8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fbxo48Q8CAT8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fbxo48Q8CAT8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fbxo48Q8CAT8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fbxo48Q8CAT8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fbxo48Q8CAT8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fbxo48Q8CAT8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fbxo48Q8CAT8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fbxo48Q8CAT8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fbxo48Q8CAT8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fbxo48Q8CAT8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fbxo48Q8CAT8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fbxo48Q8CAT8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fbxo48Q8CAT8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fbxo48Q8CAT8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fbxo48Q8CAT8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fbxo48Q8CAT8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fbxo48Q8CAT8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fbxo48Q8CAT8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fbxo48Q8CAT8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fbxo48Q8CAT8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fbxo48Q8CAT8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fbxo48Q8CAT8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms