Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5C9

TPA-induced transmembrane protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C5C9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Q8C5C9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Q8C5C9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Q8C5C9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Q8C5C9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Q8C5C9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Q8C5C9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Q8C5C9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Q8C5C9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Q8C5C9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Q8C5C9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Q8C5C9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Q8C5C9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Q8C5C9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Q8C5C9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Q8C5C9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Q8C5C9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Q8C5C9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Q8C5C9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Q8C5C9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Q8C5C9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Q8C5C9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Q8C5C9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Q8C5C9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Q8C5C9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Q8C5C9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Q8C5C9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Q8C5C9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Q8C5C9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Q8C5C9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Q8C5C9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Q8C5C9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Q8C5C9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Q8C5C9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Q8C5C9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Q8C5C9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Q8C5C9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Q8C5C9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Q8C5C9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Q8C5C9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Q8C5C9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Q8C5C9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Q8C5C9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Q8C5C9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Q8C5C9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Q8C5C9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Q8C5C9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Q8C5C9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Q8C5C9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Q8C5C9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Q8C5C9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Q8C5C9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Q8C5C9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Q8C5C9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Q8C5C9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Q8C5C9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Q8C5C9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Q8C5C9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Q8C5C9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Q8C5C9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Q8C5C9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Q8C5C9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Q8C5C9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Q8C5C9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Q8C5C9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Q8C5C9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Q8C5C9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Q8C5C9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Q8C5C9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Q8C5C9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Q8C5C9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Q8C5C9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Q8C5C9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Q8C5C9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Q8C5C9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Q8C5C9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Q8C5C9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Q8C5C9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Q8C5C9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Q8C5C9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Q8C5C9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Q8C5C9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Q8C5C9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Q8C5C9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Q8C5C9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Q8C5C9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Q8C5C9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Q8C5C9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Q8C5C9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Q8C5C9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Q8C5C9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Q8C5C9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Q8C5C9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Q8C5C9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Q8C5C9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Q8C5C9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Q8C5C9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Q8C5C9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Q8C5C9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Q8C5C9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
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