Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3M9

Uncharacterized protein C2orf80 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C3M9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Q8C3M9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q8C3M9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q8C3M9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q8C3M9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q8C3M9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q8C3M9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q8C3M9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q8C3M9 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q8C3M9 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q8C3M9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q8C3M9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q8C3M9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q8C3M9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q8C3M9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Q8C3M9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q8C3M9 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q8C3M9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Q8C3M9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q8C3M9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q8C3M9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q8C3M9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q8C3M9 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q8C3M9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q8C3M9 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q8C3M9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q8C3M9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q8C3M9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q8C3M9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q8C3M9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q8C3M9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q8C3M9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q8C3M9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q8C3M9 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q8C3M9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q8C3M9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q8C3M9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q8C3M9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q8C3M9 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q8C3M9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q8C3M9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q8C3M9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q8C3M9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q8C3M9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q8C3M9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q8C3M9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q8C3M9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q8C3M9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q8C3M9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q8C3M9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q8C3M9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q8C3M9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q8C3M9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q8C3M9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q8C3M9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q8C3M9 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q8C3M9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q8C3M9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q8C3M9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q8C3M9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q8C3M9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q8C3M9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q8C3M9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q8C3M9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q8C3M9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q8C3M9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q8C3M9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q8C3M9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q8C3M9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q8C3M9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q8C3M9 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q8C3M9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q8C3M9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q8C3M9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q8C3M9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q8C3M9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q8C3M9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q8C3M9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q8C3M9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q8C3M9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q8C3M9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q8C3M9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q8C3M9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q8C3M9 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q8C3M9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q8C3M9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q8C3M9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q8C3M9 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q8C3M9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q8C3M9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q8C3M9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q8C3M9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q8C3M9 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q8C3M9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q8C3M9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q8C3M9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q8C3M9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q8C3M9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q8C3M9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q8C3M9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms