Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0D0

Trub1, Probable tRNA pseudouridine synthase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trub1Q8C0D0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trub1Q8C0D0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trub1Q8C0D0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trub1Q8C0D0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trub1Q8C0D0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trub1Q8C0D0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trub1Q8C0D0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trub1Q8C0D0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trub1Q8C0D0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trub1Q8C0D0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trub1Q8C0D0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trub1Q8C0D0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trub1Q8C0D0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trub1Q8C0D0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trub1Q8C0D0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trub1Q8C0D0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trub1Q8C0D0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trub1Q8C0D0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trub1Q8C0D0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trub1Q8C0D0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trub1Q8C0D0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trub1Q8C0D0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trub1Q8C0D0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trub1Q8C0D0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trub1Q8C0D0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trub1Q8C0D0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trub1Q8C0D0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trub1Q8C0D0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trub1Q8C0D0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Trub1Q8C0D0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trub1Q8C0D0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trub1Q8C0D0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trub1Q8C0D0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trub1Q8C0D0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trub1Q8C0D0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trub1Q8C0D0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trub1Q8C0D0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trub1Q8C0D0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trub1Q8C0D0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trub1Q8C0D0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trub1Q8C0D0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trub1Q8C0D0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trub1Q8C0D0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trub1Q8C0D0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trub1Q8C0D0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trub1Q8C0D0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Trub1Q8C0D0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trub1Q8C0D0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trub1Q8C0D0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trub1Q8C0D0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trub1Q8C0D0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trub1Q8C0D0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trub1Q8C0D0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trub1Q8C0D0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trub1Q8C0D0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trub1Q8C0D0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trub1Q8C0D0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trub1Q8C0D0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trub1Q8C0D0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trub1Q8C0D0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trub1Q8C0D0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trub1Q8C0D0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trub1Q8C0D0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trub1Q8C0D0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trub1Q8C0D0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trub1Q8C0D0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trub1Q8C0D0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trub1Q8C0D0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trub1Q8C0D0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trub1Q8C0D0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trub1Q8C0D0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trub1Q8C0D0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Trub1Q8C0D0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trub1Q8C0D0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trub1Q8C0D0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trub1Q8C0D0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trub1Q8C0D0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trub1Q8C0D0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trub1Q8C0D0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trub1Q8C0D0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trub1Q8C0D0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trub1Q8C0D0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trub1Q8C0D0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trub1Q8C0D0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trub1Q8C0D0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trub1Q8C0D0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trub1Q8C0D0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trub1Q8C0D0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trub1Q8C0D0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trub1Q8C0D0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trub1Q8C0D0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trub1Q8C0D0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Trub1Q8C0D0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trub1Q8C0D0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Trub1Q8C0D0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trub1Q8C0D0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trub1Q8C0D0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trub1Q8C0D0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trub1Q8C0D0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trub1Q8C0D0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.2 ms