Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXS2

Tnfsfm13, Tumor necrosis factor (ligand) superfamily, membrane-bound member 13, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsfm13Q8BXS2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnfsfm13Q8BXS2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnfsfm13Q8BXS2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnfsfm13Q8BXS2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnfsfm13Q8BXS2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnfsfm13Q8BXS2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnfsfm13Q8BXS2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnfsfm13Q8BXS2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnfsfm13Q8BXS2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnfsfm13Q8BXS2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnfsfm13Q8BXS2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnfsfm13Q8BXS2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnfsfm13Q8BXS2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnfsfm13Q8BXS2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnfsfm13Q8BXS2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnfsfm13Q8BXS2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnfsfm13Q8BXS2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnfsfm13Q8BXS2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnfsfm13Q8BXS2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tnfsfm13Q8BXS2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnfsfm13Q8BXS2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnfsfm13Q8BXS2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnfsfm13Q8BXS2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnfsfm13Q8BXS2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnfsfm13Q8BXS2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnfsfm13Q8BXS2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnfsfm13Q8BXS2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnfsfm13Q8BXS2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnfsfm13Q8BXS2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnfsfm13Q8BXS2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnfsfm13Q8BXS2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnfsfm13Q8BXS2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tnfsfm13Q8BXS2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnfsfm13Q8BXS2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnfsfm13Q8BXS2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnfsfm13Q8BXS2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnfsfm13Q8BXS2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnfsfm13Q8BXS2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnfsfm13Q8BXS2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnfsfm13Q8BXS2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnfsfm13Q8BXS2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnfsfm13Q8BXS2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnfsfm13Q8BXS2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tnfsfm13Q8BXS2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tnfsfm13Q8BXS2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tnfsfm13Q8BXS2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tnfsfm13Q8BXS2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tnfsfm13Q8BXS2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tnfsfm13Q8BXS2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tnfsfm13Q8BXS2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tnfsfm13Q8BXS2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tnfsfm13Q8BXS2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tnfsfm13Q8BXS2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tnfsfm13Q8BXS2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Tnfsfm13Q8BXS2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tnfsfm13Q8BXS2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tnfsfm13Q8BXS2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tnfsfm13Q8BXS2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tnfsfm13Q8BXS2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tnfsfm13Q8BXS2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tnfsfm13Q8BXS2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tnfsfm13Q8BXS2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tnfsfm13Q8BXS2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tnfsfm13Q8BXS2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tnfsfm13Q8BXS2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tnfsfm13Q8BXS2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tnfsfm13Q8BXS2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tnfsfm13Q8BXS2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tnfsfm13Q8BXS2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tnfsfm13Q8BXS2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tnfsfm13Q8BXS2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tnfsfm13Q8BXS2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tnfsfm13Q8BXS2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tnfsfm13Q8BXS2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tnfsfm13Q8BXS2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tnfsfm13Q8BXS2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tnfsfm13Q8BXS2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tnfsfm13Q8BXS2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tnfsfm13Q8BXS2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tnfsfm13Q8BXS2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tnfsfm13Q8BXS2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tnfsfm13Q8BXS2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnfsfm13Q8BXS2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnfsfm13Q8BXS2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnfsfm13Q8BXS2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tnfsfm13Q8BXS2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tnfsfm13Q8BXS2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tnfsfm13Q8BXS2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tnfsfm13Q8BXS2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tnfsfm13Q8BXS2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tnfsfm13Q8BXS2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tnfsfm13Q8BXS2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tnfsfm13Q8BXS2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tnfsfm13Q8BXS2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms