Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Lmod1Q8BVA4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Lmod1Q8BVA4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Lmod1Q8BVA4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Lmod1Q8BVA4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Lmod1Q8BVA4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Lmod1Q8BVA4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Lmod1Q8BVA4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Lmod1Q8BVA4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Lmod1Q8BVA4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Lmod1Q8BVA4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Lmod1Q8BVA4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Lmod1Q8BVA4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Lmod1Q8BVA4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Lmod1Q8BVA4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Lmod1Q8BVA4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Lmod1Q8BVA4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Lmod1Q8BVA4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Lmod1Q8BVA4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Lmod1Q8BVA4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Lmod1Q8BVA4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Lmod1Q8BVA4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Lmod1Q8BVA4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Lmod1Q8BVA4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Lmod1Q8BVA4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Lmod1Q8BVA4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Lmod1Q8BVA4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Lmod1Q8BVA4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Lmod1Q8BVA4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Lmod1Q8BVA4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Lmod1Q8BVA4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Lmod1Q8BVA4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Lmod1Q8BVA4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Lmod1Q8BVA4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Lmod1Q8BVA4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Lmod1Q8BVA4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Lmod1Q8BVA4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Lmod1Q8BVA4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Lmod1Q8BVA4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Lmod1Q8BVA4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Lmod1Q8BVA4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Lmod1Q8BVA4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Lmod1Q8BVA4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Lmod1Q8BVA4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Lmod1Q8BVA4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Lmod1Q8BVA4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Lmod1Q8BVA4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Lmod1Q8BVA4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Lmod1Q8BVA4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Lmod1Q8BVA4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Lmod1Q8BVA4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Lmod1Q8BVA4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Lmod1Q8BVA4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Lmod1Q8BVA4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Lmod1Q8BVA4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Lmod1Q8BVA4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Lmod1Q8BVA4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Lmod1Q8BVA4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Lmod1Q8BVA4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Lmod1Q8BVA4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Lmod1Q8BVA4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Lmod1Q8BVA4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Lmod1Q8BVA4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Lmod1Q8BVA4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Lmod1Q8BVA4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Lmod1Q8BVA4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Lmod1Q8BVA4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Lmod1Q8BVA4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Lmod1Q8BVA4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Lmod1Q8BVA4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Lmod1Q8BVA4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Lmod1Q8BVA4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Lmod1Q8BVA4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Lmod1Q8BVA4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Lmod1Q8BVA4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Lmod1Q8BVA4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Lmod1Q8BVA4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Lmod1Q8BVA4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Lmod1Q8BVA4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Lmod1Q8BVA4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Lmod1Q8BVA4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Lmod1Q8BVA4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Lmod1Q8BVA4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Lmod1Q8BVA4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Lmod1Q8BVA4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Lmod1Q8BVA4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Lmod1Q8BVA4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Lmod1Q8BVA4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Lmod1Q8BVA4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Lmod1Q8BVA4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Lmod1Q8BVA4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Lmod1Q8BVA4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Lmod1Q8BVA4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Lmod1Q8BVA4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Lmod1Q8BVA4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Lmod1Q8BVA4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Lmod1Q8BVA4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Lmod1Q8BVA4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Lmod1Q8BVA4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Lmod1Q8BVA4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms