Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV66

Ifi44, Interferon-induced protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi44Q8BV66 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ifi44Q8BV66 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ifi44Q8BV66 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ifi44Q8BV66 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ifi44Q8BV66 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ifi44Q8BV66 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ifi44Q8BV66 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ifi44Q8BV66 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ifi44Q8BV66 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ifi44Q8BV66 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ifi44Q8BV66 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ifi44Q8BV66 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ifi44Q8BV66 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ifi44Q8BV66 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ifi44Q8BV66 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ifi44Q8BV66 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ifi44Q8BV66 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ifi44Q8BV66 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ifi44Q8BV66 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ifi44Q8BV66 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ifi44Q8BV66 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ifi44Q8BV66 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ifi44Q8BV66 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ifi44Q8BV66 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ifi44Q8BV66 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ifi44Q8BV66 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ifi44Q8BV66 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ifi44Q8BV66 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ifi44Q8BV66 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ifi44Q8BV66 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ifi44Q8BV66 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ifi44Q8BV66 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ifi44Q8BV66 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ifi44Q8BV66 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ifi44Q8BV66 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ifi44Q8BV66 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ifi44Q8BV66 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ifi44Q8BV66 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ifi44Q8BV66 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ifi44Q8BV66 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ifi44Q8BV66 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ifi44Q8BV66 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ifi44Q8BV66 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ifi44Q8BV66 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ifi44Q8BV66 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ifi44Q8BV66 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ifi44Q8BV66 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ifi44Q8BV66 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ifi44Q8BV66 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ifi44Q8BV66 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ifi44Q8BV66 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ifi44Q8BV66 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ifi44Q8BV66 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ifi44Q8BV66 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ifi44Q8BV66 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ifi44Q8BV66 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ifi44Q8BV66 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ifi44Q8BV66 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ifi44Q8BV66 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ifi44Q8BV66 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ifi44Q8BV66 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ifi44Q8BV66 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ifi44Q8BV66 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ifi44Q8BV66 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ifi44Q8BV66 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ifi44Q8BV66 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ifi44Q8BV66 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ifi44Q8BV66 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ifi44Q8BV66 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ifi44Q8BV66 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ifi44Q8BV66 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ifi44Q8BV66 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ifi44Q8BV66 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ifi44Q8BV66 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ifi44Q8BV66 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ifi44Q8BV66 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ifi44Q8BV66 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ifi44Q8BV66 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ifi44Q8BV66 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ifi44Q8BV66 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ifi44Q8BV66 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ifi44Q8BV66 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ifi44Q8BV66 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ifi44Q8BV66 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ifi44Q8BV66 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ifi44Q8BV66 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ifi44Q8BV66 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ifi44Q8BV66 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ifi44Q8BV66 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ifi44Q8BV66 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ifi44Q8BV66 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ifi44Q8BV66 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ifi44Q8BV66 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ifi44Q8BV66 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ifi44Q8BV66 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ifi44Q8BV66 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ifi44Q8BV66 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ifi44Q8BV66 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ifi44Q8BV66 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ifi44Q8BV66 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms