Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTI9

Pik3cb, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3cbQ8BTI9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pik3cbQ8BTI9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pik3cbQ8BTI9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pik3cbQ8BTI9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pik3cbQ8BTI9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pik3cbQ8BTI9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Pik3cbQ8BTI9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pik3cbQ8BTI9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pik3cbQ8BTI9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pik3cbQ8BTI9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pik3cbQ8BTI9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Pik3cbQ8BTI9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pik3cbQ8BTI9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pik3cbQ8BTI9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Pik3cbQ8BTI9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pik3cbQ8BTI9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pik3cbQ8BTI9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pik3cbQ8BTI9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pik3cbQ8BTI9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Pik3cbQ8BTI9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pik3cbQ8BTI9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pik3cbQ8BTI9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pik3cbQ8BTI9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pik3cbQ8BTI9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pik3cbQ8BTI9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pik3cbQ8BTI9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pik3cbQ8BTI9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pik3cbQ8BTI9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pik3cbQ8BTI9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pik3cbQ8BTI9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pik3cbQ8BTI9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pik3cbQ8BTI9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pik3cbQ8BTI9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pik3cbQ8BTI9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pik3cbQ8BTI9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pik3cbQ8BTI9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pik3cbQ8BTI9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pik3cbQ8BTI9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pik3cbQ8BTI9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pik3cbQ8BTI9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pik3cbQ8BTI9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pik3cbQ8BTI9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pik3cbQ8BTI9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Pik3cbQ8BTI9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pik3cbQ8BTI9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pik3cbQ8BTI9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Pik3cbQ8BTI9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pik3cbQ8BTI9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pik3cbQ8BTI9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pik3cbQ8BTI9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pik3cbQ8BTI9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Pik3cbQ8BTI9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pik3cbQ8BTI9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pik3cbQ8BTI9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pik3cbQ8BTI9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pik3cbQ8BTI9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pik3cbQ8BTI9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pik3cbQ8BTI9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pik3cbQ8BTI9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pik3cbQ8BTI9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Pik3cbQ8BTI9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Pik3cbQ8BTI9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pik3cbQ8BTI9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pik3cbQ8BTI9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pik3cbQ8BTI9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pik3cbQ8BTI9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pik3cbQ8BTI9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Pik3cbQ8BTI9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pik3cbQ8BTI9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pik3cbQ8BTI9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pik3cbQ8BTI9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pik3cbQ8BTI9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pik3cbQ8BTI9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pik3cbQ8BTI9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pik3cbQ8BTI9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pik3cbQ8BTI9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pik3cbQ8BTI9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pik3cbQ8BTI9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Pik3cbQ8BTI9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pik3cbQ8BTI9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pik3cbQ8BTI9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pik3cbQ8BTI9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pik3cbQ8BTI9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pik3cbQ8BTI9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pik3cbQ8BTI9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pik3cbQ8BTI9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pik3cbQ8BTI9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pik3cbQ8BTI9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pik3cbQ8BTI9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pik3cbQ8BTI9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pik3cbQ8BTI9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pik3cbQ8BTI9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pik3cbQ8BTI9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Pik3cbQ8BTI9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pik3cbQ8BTI9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pik3cbQ8BTI9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pik3cbQ8BTI9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pik3cbQ8BTI9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pik3cbQ8BTI9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pik3cbQ8BTI9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms