Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSF5

Klhl38, Kelch-like protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl38Q8BSF5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Klhl38Q8BSF5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Klhl38Q8BSF5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Klhl38Q8BSF5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Klhl38Q8BSF5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Klhl38Q8BSF5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Klhl38Q8BSF5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Klhl38Q8BSF5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Klhl38Q8BSF5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Klhl38Q8BSF5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Klhl38Q8BSF5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Klhl38Q8BSF5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Klhl38Q8BSF5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Klhl38Q8BSF5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Klhl38Q8BSF5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Klhl38Q8BSF5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Klhl38Q8BSF5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Klhl38Q8BSF5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Klhl38Q8BSF5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Klhl38Q8BSF5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Klhl38Q8BSF5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Klhl38Q8BSF5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Klhl38Q8BSF5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Klhl38Q8BSF5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Klhl38Q8BSF5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Klhl38Q8BSF5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Klhl38Q8BSF5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Klhl38Q8BSF5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Klhl38Q8BSF5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Klhl38Q8BSF5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Klhl38Q8BSF5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Klhl38Q8BSF5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Klhl38Q8BSF5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Klhl38Q8BSF5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Klhl38Q8BSF5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Klhl38Q8BSF5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Klhl38Q8BSF5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Klhl38Q8BSF5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Klhl38Q8BSF5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Klhl38Q8BSF5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Klhl38Q8BSF5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Klhl38Q8BSF5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Klhl38Q8BSF5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Klhl38Q8BSF5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Klhl38Q8BSF5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Klhl38Q8BSF5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Klhl38Q8BSF5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Klhl38Q8BSF5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Klhl38Q8BSF5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Klhl38Q8BSF5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Klhl38Q8BSF5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Klhl38Q8BSF5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Klhl38Q8BSF5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Klhl38Q8BSF5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Klhl38Q8BSF5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Klhl38Q8BSF5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Klhl38Q8BSF5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Klhl38Q8BSF5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Klhl38Q8BSF5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Klhl38Q8BSF5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Klhl38Q8BSF5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Klhl38Q8BSF5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Klhl38Q8BSF5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Klhl38Q8BSF5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Klhl38Q8BSF5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Klhl38Q8BSF5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Klhl38Q8BSF5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Klhl38Q8BSF5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Klhl38Q8BSF5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Klhl38Q8BSF5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Klhl38Q8BSF5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Klhl38Q8BSF5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Klhl38Q8BSF5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Klhl38Q8BSF5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Klhl38Q8BSF5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Klhl38Q8BSF5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Klhl38Q8BSF5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Klhl38Q8BSF5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Klhl38Q8BSF5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Klhl38Q8BSF5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Klhl38Q8BSF5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Klhl38Q8BSF5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Klhl38Q8BSF5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Klhl38Q8BSF5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Klhl38Q8BSF5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Klhl38Q8BSF5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Klhl38Q8BSF5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Klhl38Q8BSF5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Klhl38Q8BSF5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Klhl38Q8BSF5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Klhl38Q8BSF5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Klhl38Q8BSF5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Klhl38Q8BSF5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Klhl38Q8BSF5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Klhl38Q8BSF5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Klhl38Q8BSF5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Klhl38Q8BSF5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Klhl38Q8BSF5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Klhl38Q8BSF5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Klhl38Q8BSF5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms