Protein–RNA interactions for Protein: Q8BRU6

Slc18a2, Synaptic vesicular amine transporter, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc18a2Q8BRU6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc18a2Q8BRU6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc18a2Q8BRU6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc18a2Q8BRU6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc18a2Q8BRU6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc18a2Q8BRU6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc18a2Q8BRU6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc18a2Q8BRU6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc18a2Q8BRU6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc18a2Q8BRU6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc18a2Q8BRU6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc18a2Q8BRU6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc18a2Q8BRU6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc18a2Q8BRU6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc18a2Q8BRU6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc18a2Q8BRU6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc18a2Q8BRU6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc18a2Q8BRU6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc18a2Q8BRU6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc18a2Q8BRU6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc18a2Q8BRU6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc18a2Q8BRU6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc18a2Q8BRU6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc18a2Q8BRU6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc18a2Q8BRU6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc18a2Q8BRU6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc18a2Q8BRU6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc18a2Q8BRU6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc18a2Q8BRU6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc18a2Q8BRU6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Slc18a2Q8BRU6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc18a2Q8BRU6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc18a2Q8BRU6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc18a2Q8BRU6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc18a2Q8BRU6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc18a2Q8BRU6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc18a2Q8BRU6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc18a2Q8BRU6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc18a2Q8BRU6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc18a2Q8BRU6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc18a2Q8BRU6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc18a2Q8BRU6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc18a2Q8BRU6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc18a2Q8BRU6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slc18a2Q8BRU6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slc18a2Q8BRU6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slc18a2Q8BRU6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slc18a2Q8BRU6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slc18a2Q8BRU6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Slc18a2Q8BRU6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc18a2Q8BRU6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc18a2Q8BRU6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc18a2Q8BRU6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc18a2Q8BRU6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc18a2Q8BRU6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc18a2Q8BRU6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc18a2Q8BRU6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc18a2Q8BRU6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc18a2Q8BRU6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc18a2Q8BRU6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc18a2Q8BRU6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc18a2Q8BRU6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc18a2Q8BRU6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc18a2Q8BRU6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc18a2Q8BRU6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc18a2Q8BRU6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc18a2Q8BRU6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc18a2Q8BRU6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slc18a2Q8BRU6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slc18a2Q8BRU6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Slc18a2Q8BRU6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slc18a2Q8BRU6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slc18a2Q8BRU6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slc18a2Q8BRU6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slc18a2Q8BRU6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slc18a2Q8BRU6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slc18a2Q8BRU6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slc18a2Q8BRU6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slc18a2Q8BRU6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slc18a2Q8BRU6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc18a2Q8BRU6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc18a2Q8BRU6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc18a2Q8BRU6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc18a2Q8BRU6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Slc18a2Q8BRU6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slc18a2Q8BRU6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slc18a2Q8BRU6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slc18a2Q8BRU6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slc18a2Q8BRU6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slc18a2Q8BRU6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slc18a2Q8BRU6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slc18a2Q8BRU6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Slc18a2Q8BRU6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slc18a2Q8BRU6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slc18a2Q8BRU6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slc18a2Q8BRU6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slc18a2Q8BRU6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slc18a2Q8BRU6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slc18a2Q8BRU6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slc18a2Q8BRU6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms