Protein–RNA interactions for Protein: Q8BRM2

Gorab, RAB6-interacting golgin, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GorabQ8BRM2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GorabQ8BRM2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GorabQ8BRM2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GorabQ8BRM2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GorabQ8BRM2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GorabQ8BRM2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
GorabQ8BRM2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
GorabQ8BRM2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
GorabQ8BRM2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GorabQ8BRM2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GorabQ8BRM2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GorabQ8BRM2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GorabQ8BRM2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GorabQ8BRM2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GorabQ8BRM2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GorabQ8BRM2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GorabQ8BRM2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GorabQ8BRM2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
GorabQ8BRM2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
GorabQ8BRM2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
GorabQ8BRM2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
GorabQ8BRM2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
GorabQ8BRM2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
GorabQ8BRM2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
GorabQ8BRM2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GorabQ8BRM2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GorabQ8BRM2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GorabQ8BRM2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GorabQ8BRM2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
GorabQ8BRM2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
GorabQ8BRM2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
GorabQ8BRM2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
GorabQ8BRM2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
GorabQ8BRM2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
GorabQ8BRM2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GorabQ8BRM2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GorabQ8BRM2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GorabQ8BRM2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GorabQ8BRM2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GorabQ8BRM2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GorabQ8BRM2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GorabQ8BRM2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GorabQ8BRM2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
GorabQ8BRM2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
GorabQ8BRM2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GorabQ8BRM2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
GorabQ8BRM2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GorabQ8BRM2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GorabQ8BRM2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
GorabQ8BRM2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GorabQ8BRM2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GorabQ8BRM2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GorabQ8BRM2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
GorabQ8BRM2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
GorabQ8BRM2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
GorabQ8BRM2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GorabQ8BRM2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
GorabQ8BRM2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GorabQ8BRM2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GorabQ8BRM2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
GorabQ8BRM2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GorabQ8BRM2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GorabQ8BRM2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GorabQ8BRM2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GorabQ8BRM2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GorabQ8BRM2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GorabQ8BRM2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GorabQ8BRM2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GorabQ8BRM2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GorabQ8BRM2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GorabQ8BRM2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
GorabQ8BRM2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GorabQ8BRM2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
GorabQ8BRM2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GorabQ8BRM2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GorabQ8BRM2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GorabQ8BRM2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GorabQ8BRM2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GorabQ8BRM2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GorabQ8BRM2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC29■■■□□ 2.23
GorabQ8BRM2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GorabQ8BRM2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GorabQ8BRM2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GorabQ8BRM2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
GorabQ8BRM2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GorabQ8BRM2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GorabQ8BRM2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GorabQ8BRM2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
GorabQ8BRM2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GorabQ8BRM2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GorabQ8BRM2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GorabQ8BRM2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GorabQ8BRM2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GorabQ8BRM2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GorabQ8BRM2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
GorabQ8BRM2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
GorabQ8BRM2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
GorabQ8BRM2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
GorabQ8BRM2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
GorabQ8BRM2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms