Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQZ5

Cpsf4, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf4Q8BQZ5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cpsf4Q8BQZ5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cpsf4Q8BQZ5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cpsf4Q8BQZ5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cpsf4Q8BQZ5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cpsf4Q8BQZ5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cpsf4Q8BQZ5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cpsf4Q8BQZ5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cpsf4Q8BQZ5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cpsf4Q8BQZ5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cpsf4Q8BQZ5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cpsf4Q8BQZ5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cpsf4Q8BQZ5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cpsf4Q8BQZ5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cpsf4Q8BQZ5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cpsf4Q8BQZ5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cpsf4Q8BQZ5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cpsf4Q8BQZ5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cpsf4Q8BQZ5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cpsf4Q8BQZ5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cpsf4Q8BQZ5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cpsf4Q8BQZ5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cpsf4Q8BQZ5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cpsf4Q8BQZ5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cpsf4Q8BQZ5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cpsf4Q8BQZ5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cpsf4Q8BQZ5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Cpsf4Q8BQZ5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cpsf4Q8BQZ5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cpsf4Q8BQZ5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cpsf4Q8BQZ5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cpsf4Q8BQZ5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cpsf4Q8BQZ5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cpsf4Q8BQZ5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cpsf4Q8BQZ5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cpsf4Q8BQZ5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cpsf4Q8BQZ5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cpsf4Q8BQZ5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cpsf4Q8BQZ5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cpsf4Q8BQZ5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cpsf4Q8BQZ5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cpsf4Q8BQZ5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cpsf4Q8BQZ5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cpsf4Q8BQZ5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cpsf4Q8BQZ5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cpsf4Q8BQZ5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Cpsf4Q8BQZ5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cpsf4Q8BQZ5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cpsf4Q8BQZ5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cpsf4Q8BQZ5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cpsf4Q8BQZ5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cpsf4Q8BQZ5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cpsf4Q8BQZ5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cpsf4Q8BQZ5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cpsf4Q8BQZ5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Cpsf4Q8BQZ5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cpsf4Q8BQZ5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cpsf4Q8BQZ5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cpsf4Q8BQZ5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cpsf4Q8BQZ5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cpsf4Q8BQZ5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cpsf4Q8BQZ5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Cpsf4Q8BQZ5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cpsf4Q8BQZ5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cpsf4Q8BQZ5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cpsf4Q8BQZ5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cpsf4Q8BQZ5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cpsf4Q8BQZ5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cpsf4Q8BQZ5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cpsf4Q8BQZ5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cpsf4Q8BQZ5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Cpsf4Q8BQZ5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cpsf4Q8BQZ5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cpsf4Q8BQZ5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cpsf4Q8BQZ5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Cpsf4Q8BQZ5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cpsf4Q8BQZ5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cpsf4Q8BQZ5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cpsf4Q8BQZ5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cpsf4Q8BQZ5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cpsf4Q8BQZ5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cpsf4Q8BQZ5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Cpsf4Q8BQZ5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cpsf4Q8BQZ5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Cpsf4Q8BQZ5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cpsf4Q8BQZ5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cpsf4Q8BQZ5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cpsf4Q8BQZ5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cpsf4Q8BQZ5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cpsf4Q8BQZ5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cpsf4Q8BQZ5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cpsf4Q8BQZ5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cpsf4Q8BQZ5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cpsf4Q8BQZ5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cpsf4Q8BQZ5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cpsf4Q8BQZ5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cpsf4Q8BQZ5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cpsf4Q8BQZ5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cpsf4Q8BQZ5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cpsf4Q8BQZ5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.3 ms