Protein–RNA interactions for Protein: Q8BPI1

Dnaaf2, Protein kintoun, mousemouse

Predictions only

Length 814 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf2Q8BPI1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Dnaaf2Q8BPI1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Dnaaf2Q8BPI1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Dnaaf2Q8BPI1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Dnaaf2Q8BPI1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Dnaaf2Q8BPI1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Dnaaf2Q8BPI1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Dnaaf2Q8BPI1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Dnaaf2Q8BPI1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Dnaaf2Q8BPI1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Dnaaf2Q8BPI1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Dnaaf2Q8BPI1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Dnaaf2Q8BPI1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Dnaaf2Q8BPI1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Dnaaf2Q8BPI1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Dnaaf2Q8BPI1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Dnaaf2Q8BPI1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Dnaaf2Q8BPI1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Dnaaf2Q8BPI1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Dnaaf2Q8BPI1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Dnaaf2Q8BPI1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Dnaaf2Q8BPI1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Dnaaf2Q8BPI1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Dnaaf2Q8BPI1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Dnaaf2Q8BPI1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Dnaaf2Q8BPI1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Dnaaf2Q8BPI1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Dnaaf2Q8BPI1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Dnaaf2Q8BPI1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Dnaaf2Q8BPI1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Dnaaf2Q8BPI1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Dnaaf2Q8BPI1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Dnaaf2Q8BPI1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Dnaaf2Q8BPI1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Dnaaf2Q8BPI1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Dnaaf2Q8BPI1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Dnaaf2Q8BPI1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Dnaaf2Q8BPI1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Dnaaf2Q8BPI1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Dnaaf2Q8BPI1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Dnaaf2Q8BPI1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Dnaaf2Q8BPI1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Dnaaf2Q8BPI1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Dnaaf2Q8BPI1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Dnaaf2Q8BPI1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Dnaaf2Q8BPI1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Dnaaf2Q8BPI1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Dnaaf2Q8BPI1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Dnaaf2Q8BPI1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Dnaaf2Q8BPI1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Dnaaf2Q8BPI1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Dnaaf2Q8BPI1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Dnaaf2Q8BPI1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Dnaaf2Q8BPI1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Dnaaf2Q8BPI1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Dnaaf2Q8BPI1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Dnaaf2Q8BPI1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Dnaaf2Q8BPI1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Dnaaf2Q8BPI1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Dnaaf2Q8BPI1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Dnaaf2Q8BPI1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Dnaaf2Q8BPI1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Dnaaf2Q8BPI1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Dnaaf2Q8BPI1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Dnaaf2Q8BPI1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Dnaaf2Q8BPI1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Dnaaf2Q8BPI1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Dnaaf2Q8BPI1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Dnaaf2Q8BPI1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Dnaaf2Q8BPI1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Dnaaf2Q8BPI1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Dnaaf2Q8BPI1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Dnaaf2Q8BPI1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Dnaaf2Q8BPI1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Dnaaf2Q8BPI1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Dnaaf2Q8BPI1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Dnaaf2Q8BPI1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Dnaaf2Q8BPI1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Dnaaf2Q8BPI1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Dnaaf2Q8BPI1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Dnaaf2Q8BPI1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Dnaaf2Q8BPI1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Dnaaf2Q8BPI1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Dnaaf2Q8BPI1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Dnaaf2Q8BPI1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Dnaaf2Q8BPI1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Dnaaf2Q8BPI1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Dnaaf2Q8BPI1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Dnaaf2Q8BPI1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Dnaaf2Q8BPI1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Dnaaf2Q8BPI1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Dnaaf2Q8BPI1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Dnaaf2Q8BPI1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Dnaaf2Q8BPI1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Dnaaf2Q8BPI1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Dnaaf2Q8BPI1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Dnaaf2Q8BPI1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Dnaaf2Q8BPI1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Dnaaf2Q8BPI1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Dnaaf2Q8BPI1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms