Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMG1

Atrip, ATR-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtripQ8BMG1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
AtripQ8BMG1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
AtripQ8BMG1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
AtripQ8BMG1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
AtripQ8BMG1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
AtripQ8BMG1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
AtripQ8BMG1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
AtripQ8BMG1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
AtripQ8BMG1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
AtripQ8BMG1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
AtripQ8BMG1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
AtripQ8BMG1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
AtripQ8BMG1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
AtripQ8BMG1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
AtripQ8BMG1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
AtripQ8BMG1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
AtripQ8BMG1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
AtripQ8BMG1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
AtripQ8BMG1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
AtripQ8BMG1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
AtripQ8BMG1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
AtripQ8BMG1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
AtripQ8BMG1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
AtripQ8BMG1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
AtripQ8BMG1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
AtripQ8BMG1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
AtripQ8BMG1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
AtripQ8BMG1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
AtripQ8BMG1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
AtripQ8BMG1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
AtripQ8BMG1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
AtripQ8BMG1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
AtripQ8BMG1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
AtripQ8BMG1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
AtripQ8BMG1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
AtripQ8BMG1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
AtripQ8BMG1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
AtripQ8BMG1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
AtripQ8BMG1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
AtripQ8BMG1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
AtripQ8BMG1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
AtripQ8BMG1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
AtripQ8BMG1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
AtripQ8BMG1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
AtripQ8BMG1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
AtripQ8BMG1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
AtripQ8BMG1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
AtripQ8BMG1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
AtripQ8BMG1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
AtripQ8BMG1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
AtripQ8BMG1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
AtripQ8BMG1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
AtripQ8BMG1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
AtripQ8BMG1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
AtripQ8BMG1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
AtripQ8BMG1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
AtripQ8BMG1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
AtripQ8BMG1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
AtripQ8BMG1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
AtripQ8BMG1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
AtripQ8BMG1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
AtripQ8BMG1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
AtripQ8BMG1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
AtripQ8BMG1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
AtripQ8BMG1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
AtripQ8BMG1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
AtripQ8BMG1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
AtripQ8BMG1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
AtripQ8BMG1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
AtripQ8BMG1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
AtripQ8BMG1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
AtripQ8BMG1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
AtripQ8BMG1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
AtripQ8BMG1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
AtripQ8BMG1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
AtripQ8BMG1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
AtripQ8BMG1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
AtripQ8BMG1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
AtripQ8BMG1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
AtripQ8BMG1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
AtripQ8BMG1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
AtripQ8BMG1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
AtripQ8BMG1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
AtripQ8BMG1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
AtripQ8BMG1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
AtripQ8BMG1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
AtripQ8BMG1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
AtripQ8BMG1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
AtripQ8BMG1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
AtripQ8BMG1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
AtripQ8BMG1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
AtripQ8BMG1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
AtripQ8BMG1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
AtripQ8BMG1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
AtripQ8BMG1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
AtripQ8BMG1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
AtripQ8BMG1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
AtripQ8BMG1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
AtripQ8BMG1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
AtripQ8BMG1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms