Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLH7

Hirip3, HIRA-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hirip3Q8BLH7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Hirip3Q8BLH7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Hirip3Q8BLH7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Hirip3Q8BLH7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
Hirip3Q8BLH7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Hirip3Q8BLH7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Hirip3Q8BLH7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Hirip3Q8BLH7 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Hirip3Q8BLH7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Hirip3Q8BLH7 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Hirip3Q8BLH7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Hirip3Q8BLH7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
Hirip3Q8BLH7 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Hirip3Q8BLH7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Hirip3Q8BLH7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
Hirip3Q8BLH7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Hirip3Q8BLH7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Hirip3Q8BLH7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Hirip3Q8BLH7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Hirip3Q8BLH7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Hirip3Q8BLH7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
Hirip3Q8BLH7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Hirip3Q8BLH7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Hirip3Q8BLH7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
Hirip3Q8BLH7 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Hirip3Q8BLH7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Hirip3Q8BLH7 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Hirip3Q8BLH7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Hirip3Q8BLH7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Hirip3Q8BLH7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Hirip3Q8BLH7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Hirip3Q8BLH7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Hirip3Q8BLH7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Hirip3Q8BLH7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Hirip3Q8BLH7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Hirip3Q8BLH7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Hirip3Q8BLH7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Hirip3Q8BLH7 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Hirip3Q8BLH7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Hirip3Q8BLH7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Hirip3Q8BLH7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Hirip3Q8BLH7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Hirip3Q8BLH7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Hirip3Q8BLH7 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Hirip3Q8BLH7 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Hirip3Q8BLH7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
Hirip3Q8BLH7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Hirip3Q8BLH7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Hirip3Q8BLH7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Hirip3Q8BLH7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Hirip3Q8BLH7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Hirip3Q8BLH7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Hirip3Q8BLH7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Hirip3Q8BLH7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Hirip3Q8BLH7 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Hirip3Q8BLH7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Hirip3Q8BLH7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Hirip3Q8BLH7 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Hirip3Q8BLH7 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Hirip3Q8BLH7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Hirip3Q8BLH7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Hirip3Q8BLH7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Hirip3Q8BLH7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Hirip3Q8BLH7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Hirip3Q8BLH7 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Hirip3Q8BLH7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Hirip3Q8BLH7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Hirip3Q8BLH7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Hirip3Q8BLH7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Hirip3Q8BLH7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Hirip3Q8BLH7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Hirip3Q8BLH7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Hirip3Q8BLH7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
Hirip3Q8BLH7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Hirip3Q8BLH7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Hirip3Q8BLH7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Hirip3Q8BLH7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Hirip3Q8BLH7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Hirip3Q8BLH7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Hirip3Q8BLH7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Hirip3Q8BLH7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Hirip3Q8BLH7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Hirip3Q8BLH7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Hirip3Q8BLH7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Hirip3Q8BLH7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Hirip3Q8BLH7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Hirip3Q8BLH7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Hirip3Q8BLH7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Hirip3Q8BLH7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Hirip3Q8BLH7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Hirip3Q8BLH7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Hirip3Q8BLH7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Hirip3Q8BLH7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Hirip3Q8BLH7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Hirip3Q8BLH7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Hirip3Q8BLH7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Hirip3Q8BLH7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Hirip3Q8BLH7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Hirip3Q8BLH7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Hirip3Q8BLH7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms