Protein–RNA interactions for Protein: Q8BK84

Dupd1, Dual specificity phosphatase DUPD1, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dupd1Q8BK84 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Dupd1Q8BK84 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Dupd1Q8BK84 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Dupd1Q8BK84 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Dupd1Q8BK84 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Dupd1Q8BK84 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Dupd1Q8BK84 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Dupd1Q8BK84 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Dupd1Q8BK84 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Dupd1Q8BK84 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Dupd1Q8BK84 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Dupd1Q8BK84 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Dupd1Q8BK84 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Dupd1Q8BK84 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Dupd1Q8BK84 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Dupd1Q8BK84 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Dupd1Q8BK84 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Dupd1Q8BK84 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Dupd1Q8BK84 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Dupd1Q8BK84 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Dupd1Q8BK84 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Dupd1Q8BK84 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Dupd1Q8BK84 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Dupd1Q8BK84 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Dupd1Q8BK84 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Dupd1Q8BK84 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Dupd1Q8BK84 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Dupd1Q8BK84 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Dupd1Q8BK84 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Dupd1Q8BK84 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Dupd1Q8BK84 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Dupd1Q8BK84 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Dupd1Q8BK84 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Dupd1Q8BK84 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Dupd1Q8BK84 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Dupd1Q8BK84 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Dupd1Q8BK84 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Dupd1Q8BK84 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Dupd1Q8BK84 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Dupd1Q8BK84 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dupd1Q8BK84 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dupd1Q8BK84 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Dupd1Q8BK84 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Dupd1Q8BK84 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Dupd1Q8BK84 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Dupd1Q8BK84 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Dupd1Q8BK84 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Dupd1Q8BK84 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Dupd1Q8BK84 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dupd1Q8BK84 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dupd1Q8BK84 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dupd1Q8BK84 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dupd1Q8BK84 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dupd1Q8BK84 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dupd1Q8BK84 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dupd1Q8BK84 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dupd1Q8BK84 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dupd1Q8BK84 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Dupd1Q8BK84 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Dupd1Q8BK84 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dupd1Q8BK84 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Dupd1Q8BK84 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dupd1Q8BK84 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dupd1Q8BK84 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dupd1Q8BK84 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dupd1Q8BK84 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dupd1Q8BK84 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Dupd1Q8BK84 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Dupd1Q8BK84 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Dupd1Q8BK84 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Dupd1Q8BK84 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dupd1Q8BK84 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dupd1Q8BK84 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dupd1Q8BK84 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dupd1Q8BK84 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dupd1Q8BK84 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dupd1Q8BK84 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dupd1Q8BK84 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Dupd1Q8BK84 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Dupd1Q8BK84 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Dupd1Q8BK84 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Dupd1Q8BK84 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Dupd1Q8BK84 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dupd1Q8BK84 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dupd1Q8BK84 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dupd1Q8BK84 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dupd1Q8BK84 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dupd1Q8BK84 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dupd1Q8BK84 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dupd1Q8BK84 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dupd1Q8BK84 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Dupd1Q8BK84 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Dupd1Q8BK84 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Dupd1Q8BK84 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Dupd1Q8BK84 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Dupd1Q8BK84 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Dupd1Q8BK84 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Dupd1Q8BK84 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Dupd1Q8BK84 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Dupd1Q8BK84 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms