Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJL0

Smarcal1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcal1Q8BJL0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Smarcal1Q8BJL0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Smarcal1Q8BJL0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Smarcal1Q8BJL0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Smarcal1Q8BJL0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Smarcal1Q8BJL0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Smarcal1Q8BJL0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Smarcal1Q8BJL0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Smarcal1Q8BJL0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Smarcal1Q8BJL0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Smarcal1Q8BJL0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Smarcal1Q8BJL0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Smarcal1Q8BJL0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Smarcal1Q8BJL0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Smarcal1Q8BJL0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Smarcal1Q8BJL0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Smarcal1Q8BJL0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Smarcal1Q8BJL0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Smarcal1Q8BJL0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Smarcal1Q8BJL0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Smarcal1Q8BJL0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Smarcal1Q8BJL0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Smarcal1Q8BJL0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Smarcal1Q8BJL0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Smarcal1Q8BJL0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Smarcal1Q8BJL0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Smarcal1Q8BJL0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Smarcal1Q8BJL0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Smarcal1Q8BJL0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Smarcal1Q8BJL0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Smarcal1Q8BJL0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Smarcal1Q8BJL0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Smarcal1Q8BJL0 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Smarcal1Q8BJL0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Smarcal1Q8BJL0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Smarcal1Q8BJL0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Smarcal1Q8BJL0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Smarcal1Q8BJL0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Smarcal1Q8BJL0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Smarcal1Q8BJL0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Smarcal1Q8BJL0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Smarcal1Q8BJL0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Smarcal1Q8BJL0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Smarcal1Q8BJL0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Smarcal1Q8BJL0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Smarcal1Q8BJL0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Smarcal1Q8BJL0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Smarcal1Q8BJL0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Smarcal1Q8BJL0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Smarcal1Q8BJL0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Smarcal1Q8BJL0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Smarcal1Q8BJL0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Smarcal1Q8BJL0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Smarcal1Q8BJL0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Smarcal1Q8BJL0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Smarcal1Q8BJL0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Smarcal1Q8BJL0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Smarcal1Q8BJL0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Smarcal1Q8BJL0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Smarcal1Q8BJL0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Smarcal1Q8BJL0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Smarcal1Q8BJL0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Smarcal1Q8BJL0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Smarcal1Q8BJL0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Smarcal1Q8BJL0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Smarcal1Q8BJL0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Smarcal1Q8BJL0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Smarcal1Q8BJL0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Smarcal1Q8BJL0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Smarcal1Q8BJL0 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Smarcal1Q8BJL0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Smarcal1Q8BJL0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Smarcal1Q8BJL0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Smarcal1Q8BJL0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Smarcal1Q8BJL0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Smarcal1Q8BJL0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Smarcal1Q8BJL0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Smarcal1Q8BJL0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Smarcal1Q8BJL0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Smarcal1Q8BJL0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Smarcal1Q8BJL0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Smarcal1Q8BJL0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Smarcal1Q8BJL0 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Smarcal1Q8BJL0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Smarcal1Q8BJL0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Smarcal1Q8BJL0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Smarcal1Q8BJL0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Smarcal1Q8BJL0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Smarcal1Q8BJL0 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Smarcal1Q8BJL0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Smarcal1Q8BJL0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Smarcal1Q8BJL0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Smarcal1Q8BJL0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Smarcal1Q8BJL0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Smarcal1Q8BJL0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Smarcal1Q8BJL0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Smarcal1Q8BJL0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Smarcal1Q8BJL0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Smarcal1Q8BJL0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Smarcal1Q8BJL0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms