Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH24

Tm9sf4, Transmembrane 9 superfamily member 4, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf4Q8BH24 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tm9sf4Q8BH24 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tm9sf4Q8BH24 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tm9sf4Q8BH24 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tm9sf4Q8BH24 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tm9sf4Q8BH24 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tm9sf4Q8BH24 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tm9sf4Q8BH24 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tm9sf4Q8BH24 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tm9sf4Q8BH24 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tm9sf4Q8BH24 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tm9sf4Q8BH24 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tm9sf4Q8BH24 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tm9sf4Q8BH24 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tm9sf4Q8BH24 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tm9sf4Q8BH24 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tm9sf4Q8BH24 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tm9sf4Q8BH24 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tm9sf4Q8BH24 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tm9sf4Q8BH24 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tm9sf4Q8BH24 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tm9sf4Q8BH24 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tm9sf4Q8BH24 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tm9sf4Q8BH24 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tm9sf4Q8BH24 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tm9sf4Q8BH24 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tm9sf4Q8BH24 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tm9sf4Q8BH24 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tm9sf4Q8BH24 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tm9sf4Q8BH24 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tm9sf4Q8BH24 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tm9sf4Q8BH24 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tm9sf4Q8BH24 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tm9sf4Q8BH24 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tm9sf4Q8BH24 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tm9sf4Q8BH24 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tm9sf4Q8BH24 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tm9sf4Q8BH24 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tm9sf4Q8BH24 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tm9sf4Q8BH24 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tm9sf4Q8BH24 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tm9sf4Q8BH24 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tm9sf4Q8BH24 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Tm9sf4Q8BH24 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tm9sf4Q8BH24 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tm9sf4Q8BH24 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tm9sf4Q8BH24 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Tm9sf4Q8BH24 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tm9sf4Q8BH24 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tm9sf4Q8BH24 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tm9sf4Q8BH24 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tm9sf4Q8BH24 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tm9sf4Q8BH24 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tm9sf4Q8BH24 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tm9sf4Q8BH24 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tm9sf4Q8BH24 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tm9sf4Q8BH24 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tm9sf4Q8BH24 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tm9sf4Q8BH24 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tm9sf4Q8BH24 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tm9sf4Q8BH24 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tm9sf4Q8BH24 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tm9sf4Q8BH24 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tm9sf4Q8BH24 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tm9sf4Q8BH24 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tm9sf4Q8BH24 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tm9sf4Q8BH24 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tm9sf4Q8BH24 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tm9sf4Q8BH24 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tm9sf4Q8BH24 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tm9sf4Q8BH24 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tm9sf4Q8BH24 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tm9sf4Q8BH24 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tm9sf4Q8BH24 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tm9sf4Q8BH24 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tm9sf4Q8BH24 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tm9sf4Q8BH24 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tm9sf4Q8BH24 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tm9sf4Q8BH24 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Tm9sf4Q8BH24 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tm9sf4Q8BH24 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tm9sf4Q8BH24 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tm9sf4Q8BH24 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tm9sf4Q8BH24 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tm9sf4Q8BH24 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tm9sf4Q8BH24 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tm9sf4Q8BH24 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tm9sf4Q8BH24 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tm9sf4Q8BH24 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tm9sf4Q8BH24 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tm9sf4Q8BH24 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tm9sf4Q8BH24 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tm9sf4Q8BH24 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tm9sf4Q8BH24 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tm9sf4Q8BH24 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tm9sf4Q8BH24 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tm9sf4Q8BH24 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tm9sf4Q8BH24 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tm9sf4Q8BH24 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tm9sf4Q8BH24 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms