Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGZ1

Hpcal4, Hippocalcin-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpcal4Q8BGZ1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Hpcal4Q8BGZ1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hpcal4Q8BGZ1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Hpcal4Q8BGZ1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Hpcal4Q8BGZ1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hpcal4Q8BGZ1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hpcal4Q8BGZ1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hpcal4Q8BGZ1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hpcal4Q8BGZ1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hpcal4Q8BGZ1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hpcal4Q8BGZ1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hpcal4Q8BGZ1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hpcal4Q8BGZ1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hpcal4Q8BGZ1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hpcal4Q8BGZ1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hpcal4Q8BGZ1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hpcal4Q8BGZ1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Hpcal4Q8BGZ1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Hpcal4Q8BGZ1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Hpcal4Q8BGZ1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Hpcal4Q8BGZ1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Hpcal4Q8BGZ1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hpcal4Q8BGZ1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hpcal4Q8BGZ1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hpcal4Q8BGZ1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hpcal4Q8BGZ1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hpcal4Q8BGZ1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hpcal4Q8BGZ1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hpcal4Q8BGZ1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hpcal4Q8BGZ1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hpcal4Q8BGZ1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hpcal4Q8BGZ1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hpcal4Q8BGZ1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hpcal4Q8BGZ1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hpcal4Q8BGZ1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hpcal4Q8BGZ1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hpcal4Q8BGZ1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hpcal4Q8BGZ1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Hpcal4Q8BGZ1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Hpcal4Q8BGZ1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hpcal4Q8BGZ1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Hpcal4Q8BGZ1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hpcal4Q8BGZ1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hpcal4Q8BGZ1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hpcal4Q8BGZ1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hpcal4Q8BGZ1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hpcal4Q8BGZ1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hpcal4Q8BGZ1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hpcal4Q8BGZ1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hpcal4Q8BGZ1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hpcal4Q8BGZ1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hpcal4Q8BGZ1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hpcal4Q8BGZ1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hpcal4Q8BGZ1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Hpcal4Q8BGZ1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hpcal4Q8BGZ1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hpcal4Q8BGZ1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hpcal4Q8BGZ1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hpcal4Q8BGZ1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hpcal4Q8BGZ1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Hpcal4Q8BGZ1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hpcal4Q8BGZ1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hpcal4Q8BGZ1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hpcal4Q8BGZ1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hpcal4Q8BGZ1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hpcal4Q8BGZ1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hpcal4Q8BGZ1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hpcal4Q8BGZ1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hpcal4Q8BGZ1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hpcal4Q8BGZ1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hpcal4Q8BGZ1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hpcal4Q8BGZ1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hpcal4Q8BGZ1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hpcal4Q8BGZ1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hpcal4Q8BGZ1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hpcal4Q8BGZ1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Hpcal4Q8BGZ1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hpcal4Q8BGZ1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hpcal4Q8BGZ1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hpcal4Q8BGZ1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hpcal4Q8BGZ1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hpcal4Q8BGZ1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hpcal4Q8BGZ1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hpcal4Q8BGZ1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hpcal4Q8BGZ1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hpcal4Q8BGZ1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hpcal4Q8BGZ1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hpcal4Q8BGZ1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hpcal4Q8BGZ1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Hpcal4Q8BGZ1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hpcal4Q8BGZ1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hpcal4Q8BGZ1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Hpcal4Q8BGZ1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hpcal4Q8BGZ1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hpcal4Q8BGZ1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hpcal4Q8BGZ1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hpcal4Q8BGZ1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hpcal4Q8BGZ1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hpcal4Q8BGZ1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hpcal4Q8BGZ1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms