Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGW3

Bhlhe23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe23Q8BGW3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Bhlhe23Q8BGW3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Bhlhe23Q8BGW3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Bhlhe23Q8BGW3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Bhlhe23Q8BGW3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Bhlhe23Q8BGW3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Bhlhe23Q8BGW3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Bhlhe23Q8BGW3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Bhlhe23Q8BGW3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Bhlhe23Q8BGW3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Bhlhe23Q8BGW3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Bhlhe23Q8BGW3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Bhlhe23Q8BGW3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Bhlhe23Q8BGW3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Bhlhe23Q8BGW3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Bhlhe23Q8BGW3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Bhlhe23Q8BGW3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Bhlhe23Q8BGW3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Bhlhe23Q8BGW3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Bhlhe23Q8BGW3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Bhlhe23Q8BGW3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Bhlhe23Q8BGW3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Bhlhe23Q8BGW3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Bhlhe23Q8BGW3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Bhlhe23Q8BGW3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Bhlhe23Q8BGW3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Bhlhe23Q8BGW3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Bhlhe23Q8BGW3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Bhlhe23Q8BGW3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Bhlhe23Q8BGW3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Bhlhe23Q8BGW3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Bhlhe23Q8BGW3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Bhlhe23Q8BGW3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Bhlhe23Q8BGW3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Bhlhe23Q8BGW3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Bhlhe23Q8BGW3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Bhlhe23Q8BGW3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Bhlhe23Q8BGW3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Bhlhe23Q8BGW3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Bhlhe23Q8BGW3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Bhlhe23Q8BGW3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Bhlhe23Q8BGW3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Bhlhe23Q8BGW3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Bhlhe23Q8BGW3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Bhlhe23Q8BGW3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bhlhe23Q8BGW3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bhlhe23Q8BGW3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bhlhe23Q8BGW3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Bhlhe23Q8BGW3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Bhlhe23Q8BGW3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Bhlhe23Q8BGW3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Bhlhe23Q8BGW3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Bhlhe23Q8BGW3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Bhlhe23Q8BGW3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Bhlhe23Q8BGW3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Bhlhe23Q8BGW3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Bhlhe23Q8BGW3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Bhlhe23Q8BGW3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Bhlhe23Q8BGW3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Bhlhe23Q8BGW3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Bhlhe23Q8BGW3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Bhlhe23Q8BGW3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Bhlhe23Q8BGW3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Bhlhe23Q8BGW3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Bhlhe23Q8BGW3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Bhlhe23Q8BGW3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Bhlhe23Q8BGW3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Bhlhe23Q8BGW3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Bhlhe23Q8BGW3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Bhlhe23Q8BGW3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Bhlhe23Q8BGW3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Bhlhe23Q8BGW3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Bhlhe23Q8BGW3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Bhlhe23Q8BGW3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Bhlhe23Q8BGW3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Bhlhe23Q8BGW3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Bhlhe23Q8BGW3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Bhlhe23Q8BGW3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Bhlhe23Q8BGW3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Bhlhe23Q8BGW3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Bhlhe23Q8BGW3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Bhlhe23Q8BGW3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Bhlhe23Q8BGW3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Bhlhe23Q8BGW3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Bhlhe23Q8BGW3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Bhlhe23Q8BGW3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Bhlhe23Q8BGW3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Bhlhe23Q8BGW3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Bhlhe23Q8BGW3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Bhlhe23Q8BGW3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Bhlhe23Q8BGW3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Bhlhe23Q8BGW3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Bhlhe23Q8BGW3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Bhlhe23Q8BGW3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Bhlhe23Q8BGW3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Bhlhe23Q8BGW3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Bhlhe23Q8BGW3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Bhlhe23Q8BGW3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Bhlhe23Q8BGW3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Bhlhe23Q8BGW3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms