Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU5

Ccny, Cyclin-Y, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnyQ8BGU5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CcnyQ8BGU5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CcnyQ8BGU5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CcnyQ8BGU5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CcnyQ8BGU5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CcnyQ8BGU5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CcnyQ8BGU5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CcnyQ8BGU5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CcnyQ8BGU5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CcnyQ8BGU5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CcnyQ8BGU5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CcnyQ8BGU5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CcnyQ8BGU5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CcnyQ8BGU5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CcnyQ8BGU5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CcnyQ8BGU5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CcnyQ8BGU5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CcnyQ8BGU5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CcnyQ8BGU5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CcnyQ8BGU5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CcnyQ8BGU5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CcnyQ8BGU5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CcnyQ8BGU5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CcnyQ8BGU5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CcnyQ8BGU5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CcnyQ8BGU5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CcnyQ8BGU5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CcnyQ8BGU5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CcnyQ8BGU5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CcnyQ8BGU5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CcnyQ8BGU5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CcnyQ8BGU5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CcnyQ8BGU5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CcnyQ8BGU5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CcnyQ8BGU5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CcnyQ8BGU5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CcnyQ8BGU5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CcnyQ8BGU5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CcnyQ8BGU5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CcnyQ8BGU5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CcnyQ8BGU5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CcnyQ8BGU5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CcnyQ8BGU5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CcnyQ8BGU5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CcnyQ8BGU5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CcnyQ8BGU5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CcnyQ8BGU5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CcnyQ8BGU5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CcnyQ8BGU5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CcnyQ8BGU5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CcnyQ8BGU5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CcnyQ8BGU5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CcnyQ8BGU5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CcnyQ8BGU5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CcnyQ8BGU5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CcnyQ8BGU5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CcnyQ8BGU5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CcnyQ8BGU5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CcnyQ8BGU5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CcnyQ8BGU5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CcnyQ8BGU5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CcnyQ8BGU5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CcnyQ8BGU5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CcnyQ8BGU5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CcnyQ8BGU5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CcnyQ8BGU5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CcnyQ8BGU5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CcnyQ8BGU5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CcnyQ8BGU5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CcnyQ8BGU5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CcnyQ8BGU5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CcnyQ8BGU5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CcnyQ8BGU5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CcnyQ8BGU5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CcnyQ8BGU5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CcnyQ8BGU5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CcnyQ8BGU5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CcnyQ8BGU5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CcnyQ8BGU5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CcnyQ8BGU5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CcnyQ8BGU5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CcnyQ8BGU5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CcnyQ8BGU5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CcnyQ8BGU5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CcnyQ8BGU5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CcnyQ8BGU5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CcnyQ8BGU5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CcnyQ8BGU5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CcnyQ8BGU5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CcnyQ8BGU5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CcnyQ8BGU5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CcnyQ8BGU5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CcnyQ8BGU5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CcnyQ8BGU5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CcnyQ8BGU5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CcnyQ8BGU5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CcnyQ8BGU5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CcnyQ8BGU5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CcnyQ8BGU5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CcnyQ8BGU5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms