Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGM5

Best2, Bestrophin-2, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Best2Q8BGM5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Best2Q8BGM5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Best2Q8BGM5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Best2Q8BGM5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Best2Q8BGM5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Best2Q8BGM5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Best2Q8BGM5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Best2Q8BGM5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Best2Q8BGM5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Best2Q8BGM5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Best2Q8BGM5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Best2Q8BGM5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Best2Q8BGM5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Best2Q8BGM5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Best2Q8BGM5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Best2Q8BGM5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Best2Q8BGM5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Best2Q8BGM5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Best2Q8BGM5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Best2Q8BGM5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Best2Q8BGM5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Best2Q8BGM5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Best2Q8BGM5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Best2Q8BGM5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Best2Q8BGM5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Best2Q8BGM5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Best2Q8BGM5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Best2Q8BGM5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Best2Q8BGM5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Best2Q8BGM5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Best2Q8BGM5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Best2Q8BGM5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Best2Q8BGM5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Best2Q8BGM5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Best2Q8BGM5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Best2Q8BGM5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Best2Q8BGM5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Best2Q8BGM5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Best2Q8BGM5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Best2Q8BGM5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Best2Q8BGM5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Best2Q8BGM5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Best2Q8BGM5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Best2Q8BGM5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Best2Q8BGM5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Best2Q8BGM5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Best2Q8BGM5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Best2Q8BGM5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Best2Q8BGM5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Best2Q8BGM5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Best2Q8BGM5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Best2Q8BGM5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Best2Q8BGM5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Best2Q8BGM5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Best2Q8BGM5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Best2Q8BGM5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Best2Q8BGM5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Best2Q8BGM5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Best2Q8BGM5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Best2Q8BGM5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Best2Q8BGM5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Best2Q8BGM5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Best2Q8BGM5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Best2Q8BGM5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Best2Q8BGM5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Best2Q8BGM5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Best2Q8BGM5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Best2Q8BGM5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Best2Q8BGM5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Best2Q8BGM5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Best2Q8BGM5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Best2Q8BGM5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Best2Q8BGM5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Best2Q8BGM5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Best2Q8BGM5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Best2Q8BGM5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Best2Q8BGM5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Best2Q8BGM5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Best2Q8BGM5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Best2Q8BGM5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Best2Q8BGM5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Best2Q8BGM5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Best2Q8BGM5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Best2Q8BGM5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Best2Q8BGM5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Best2Q8BGM5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Best2Q8BGM5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Best2Q8BGM5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Best2Q8BGM5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Best2Q8BGM5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Best2Q8BGM5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Best2Q8BGM5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Best2Q8BGM5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Best2Q8BGM5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Best2Q8BGM5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Best2Q8BGM5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Best2Q8BGM5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Best2Q8BGM5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Best2Q8BGM5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Best2Q8BGM5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms