Protein–RNA interactions for Protein: Q80YR7

Clspn, Claspin, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClspnQ80YR7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
ClspnQ80YR7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
ClspnQ80YR7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
ClspnQ80YR7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
ClspnQ80YR7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
ClspnQ80YR7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
ClspnQ80YR7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
ClspnQ80YR7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
ClspnQ80YR7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
ClspnQ80YR7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
ClspnQ80YR7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
ClspnQ80YR7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
ClspnQ80YR7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
ClspnQ80YR7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
ClspnQ80YR7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
ClspnQ80YR7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
ClspnQ80YR7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
ClspnQ80YR7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
ClspnQ80YR7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
ClspnQ80YR7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
ClspnQ80YR7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
ClspnQ80YR7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
ClspnQ80YR7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
ClspnQ80YR7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
ClspnQ80YR7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
ClspnQ80YR7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
ClspnQ80YR7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
ClspnQ80YR7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
ClspnQ80YR7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
ClspnQ80YR7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC33.96■■■■□ 3.03
ClspnQ80YR7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
ClspnQ80YR7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
ClspnQ80YR7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
ClspnQ80YR7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
ClspnQ80YR7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
ClspnQ80YR7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
ClspnQ80YR7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
ClspnQ80YR7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
ClspnQ80YR7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
ClspnQ80YR7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
ClspnQ80YR7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
ClspnQ80YR7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
ClspnQ80YR7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
ClspnQ80YR7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
ClspnQ80YR7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
ClspnQ80YR7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
ClspnQ80YR7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
ClspnQ80YR7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
ClspnQ80YR7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
ClspnQ80YR7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
ClspnQ80YR7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
ClspnQ80YR7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
ClspnQ80YR7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
ClspnQ80YR7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
ClspnQ80YR7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
ClspnQ80YR7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
ClspnQ80YR7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
ClspnQ80YR7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
ClspnQ80YR7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC33.82■■■■□ 3
ClspnQ80YR7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
ClspnQ80YR7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
ClspnQ80YR7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
ClspnQ80YR7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
ClspnQ80YR7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
ClspnQ80YR7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
ClspnQ80YR7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
ClspnQ80YR7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
ClspnQ80YR7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
ClspnQ80YR7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
ClspnQ80YR7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
ClspnQ80YR7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
ClspnQ80YR7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
ClspnQ80YR7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
ClspnQ80YR7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
ClspnQ80YR7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
ClspnQ80YR7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
ClspnQ80YR7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
ClspnQ80YR7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
ClspnQ80YR7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
ClspnQ80YR7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
ClspnQ80YR7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
ClspnQ80YR7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
ClspnQ80YR7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
ClspnQ80YR7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
ClspnQ80YR7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
ClspnQ80YR7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
ClspnQ80YR7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
ClspnQ80YR7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
ClspnQ80YR7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
ClspnQ80YR7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
ClspnQ80YR7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
ClspnQ80YR7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
ClspnQ80YR7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
ClspnQ80YR7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
ClspnQ80YR7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
ClspnQ80YR7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
ClspnQ80YR7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
ClspnQ80YR7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
ClspnQ80YR7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
ClspnQ80YR7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms