Protein–RNA interactions for Protein: Q80YR6

Rbbp8, DNA endonuclease RBBP8, mousemouse

Predictions only

Length 893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8Q80YR6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rbbp8Q80YR6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rbbp8Q80YR6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Rbbp8Q80YR6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rbbp8Q80YR6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rbbp8Q80YR6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rbbp8Q80YR6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rbbp8Q80YR6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rbbp8Q80YR6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rbbp8Q80YR6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rbbp8Q80YR6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rbbp8Q80YR6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rbbp8Q80YR6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rbbp8Q80YR6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rbbp8Q80YR6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rbbp8Q80YR6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rbbp8Q80YR6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rbbp8Q80YR6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rbbp8Q80YR6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rbbp8Q80YR6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rbbp8Q80YR6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rbbp8Q80YR6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rbbp8Q80YR6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rbbp8Q80YR6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rbbp8Q80YR6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rbbp8Q80YR6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rbbp8Q80YR6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rbbp8Q80YR6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rbbp8Q80YR6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rbbp8Q80YR6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rbbp8Q80YR6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rbbp8Q80YR6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rbbp8Q80YR6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rbbp8Q80YR6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rbbp8Q80YR6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rbbp8Q80YR6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rbbp8Q80YR6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rbbp8Q80YR6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rbbp8Q80YR6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Rbbp8Q80YR6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rbbp8Q80YR6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rbbp8Q80YR6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rbbp8Q80YR6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rbbp8Q80YR6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rbbp8Q80YR6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rbbp8Q80YR6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rbbp8Q80YR6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rbbp8Q80YR6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rbbp8Q80YR6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rbbp8Q80YR6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rbbp8Q80YR6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rbbp8Q80YR6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rbbp8Q80YR6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rbbp8Q80YR6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Rbbp8Q80YR6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Rbbp8Q80YR6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Rbbp8Q80YR6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rbbp8Q80YR6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rbbp8Q80YR6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rbbp8Q80YR6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Rbbp8Q80YR6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rbbp8Q80YR6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rbbp8Q80YR6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rbbp8Q80YR6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rbbp8Q80YR6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rbbp8Q80YR6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rbbp8Q80YR6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rbbp8Q80YR6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rbbp8Q80YR6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rbbp8Q80YR6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rbbp8Q80YR6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rbbp8Q80YR6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rbbp8Q80YR6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rbbp8Q80YR6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rbbp8Q80YR6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rbbp8Q80YR6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rbbp8Q80YR6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rbbp8Q80YR6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rbbp8Q80YR6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rbbp8Q80YR6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rbbp8Q80YR6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rbbp8Q80YR6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rbbp8Q80YR6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Rbbp8Q80YR6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rbbp8Q80YR6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rbbp8Q80YR6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rbbp8Q80YR6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rbbp8Q80YR6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rbbp8Q80YR6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rbbp8Q80YR6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Rbbp8Q80YR6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Rbbp8Q80YR6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rbbp8Q80YR6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rbbp8Q80YR6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rbbp8Q80YR6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Rbbp8Q80YR6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rbbp8Q80YR6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rbbp8Q80YR6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rbbp8Q80YR6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rbbp8Q80YR6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms