Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y20

Alkbh8, Alkylated DNA repair protein alkB homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh8Q80Y20 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Alkbh8Q80Y20 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Alkbh8Q80Y20 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Alkbh8Q80Y20 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Alkbh8Q80Y20 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Alkbh8Q80Y20 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Alkbh8Q80Y20 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Alkbh8Q80Y20 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Alkbh8Q80Y20 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Alkbh8Q80Y20 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Alkbh8Q80Y20 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Alkbh8Q80Y20 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Alkbh8Q80Y20 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Alkbh8Q80Y20 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Alkbh8Q80Y20 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Alkbh8Q80Y20 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Alkbh8Q80Y20 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Alkbh8Q80Y20 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Alkbh8Q80Y20 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Alkbh8Q80Y20 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Alkbh8Q80Y20 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Alkbh8Q80Y20 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Alkbh8Q80Y20 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Alkbh8Q80Y20 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Alkbh8Q80Y20 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Alkbh8Q80Y20 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Alkbh8Q80Y20 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Alkbh8Q80Y20 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Alkbh8Q80Y20 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Alkbh8Q80Y20 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Alkbh8Q80Y20 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Alkbh8Q80Y20 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Alkbh8Q80Y20 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Alkbh8Q80Y20 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Alkbh8Q80Y20 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Alkbh8Q80Y20 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Alkbh8Q80Y20 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Alkbh8Q80Y20 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Alkbh8Q80Y20 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Alkbh8Q80Y20 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Alkbh8Q80Y20 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Alkbh8Q80Y20 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Alkbh8Q80Y20 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Alkbh8Q80Y20 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Alkbh8Q80Y20 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Alkbh8Q80Y20 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Alkbh8Q80Y20 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Alkbh8Q80Y20 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Alkbh8Q80Y20 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Alkbh8Q80Y20 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Alkbh8Q80Y20 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Alkbh8Q80Y20 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Alkbh8Q80Y20 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Alkbh8Q80Y20 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Alkbh8Q80Y20 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Alkbh8Q80Y20 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Alkbh8Q80Y20 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Alkbh8Q80Y20 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Alkbh8Q80Y20 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Alkbh8Q80Y20 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Alkbh8Q80Y20 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Alkbh8Q80Y20 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Alkbh8Q80Y20 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Alkbh8Q80Y20 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Alkbh8Q80Y20 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Alkbh8Q80Y20 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Alkbh8Q80Y20 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Alkbh8Q80Y20 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Alkbh8Q80Y20 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Alkbh8Q80Y20 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Alkbh8Q80Y20 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Alkbh8Q80Y20 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Alkbh8Q80Y20 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Alkbh8Q80Y20 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Alkbh8Q80Y20 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Alkbh8Q80Y20 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Alkbh8Q80Y20 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Alkbh8Q80Y20 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Alkbh8Q80Y20 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Alkbh8Q80Y20 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Alkbh8Q80Y20 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Alkbh8Q80Y20 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Alkbh8Q80Y20 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Alkbh8Q80Y20 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Alkbh8Q80Y20 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Alkbh8Q80Y20 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Alkbh8Q80Y20 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Alkbh8Q80Y20 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Alkbh8Q80Y20 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Alkbh8Q80Y20 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Alkbh8Q80Y20 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Alkbh8Q80Y20 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Alkbh8Q80Y20 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Alkbh8Q80Y20 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Alkbh8Q80Y20 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Alkbh8Q80Y20 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Alkbh8Q80Y20 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Alkbh8Q80Y20 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Alkbh8Q80Y20 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Alkbh8Q80Y20 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.8 ms