Protein–RNA interactions for Protein: Q80W37

Snupn, Snurportin-1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnupnQ80W37 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SnupnQ80W37 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SnupnQ80W37 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SnupnQ80W37 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SnupnQ80W37 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SnupnQ80W37 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SnupnQ80W37 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SnupnQ80W37 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SnupnQ80W37 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SnupnQ80W37 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SnupnQ80W37 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SnupnQ80W37 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SnupnQ80W37 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SnupnQ80W37 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SnupnQ80W37 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SnupnQ80W37 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SnupnQ80W37 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SnupnQ80W37 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SnupnQ80W37 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SnupnQ80W37 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SnupnQ80W37 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SnupnQ80W37 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SnupnQ80W37 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SnupnQ80W37 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SnupnQ80W37 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SnupnQ80W37 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SnupnQ80W37 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SnupnQ80W37 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SnupnQ80W37 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SnupnQ80W37 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SnupnQ80W37 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SnupnQ80W37 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SnupnQ80W37 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SnupnQ80W37 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SnupnQ80W37 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SnupnQ80W37 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SnupnQ80W37 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SnupnQ80W37 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SnupnQ80W37 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SnupnQ80W37 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SnupnQ80W37 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SnupnQ80W37 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SnupnQ80W37 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SnupnQ80W37 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SnupnQ80W37 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SnupnQ80W37 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SnupnQ80W37 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SnupnQ80W37 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SnupnQ80W37 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SnupnQ80W37 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SnupnQ80W37 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SnupnQ80W37 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SnupnQ80W37 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SnupnQ80W37 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SnupnQ80W37 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SnupnQ80W37 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SnupnQ80W37 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SnupnQ80W37 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SnupnQ80W37 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SnupnQ80W37 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SnupnQ80W37 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SnupnQ80W37 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SnupnQ80W37 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SnupnQ80W37 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SnupnQ80W37 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SnupnQ80W37 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SnupnQ80W37 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SnupnQ80W37 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SnupnQ80W37 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SnupnQ80W37 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SnupnQ80W37 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SnupnQ80W37 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SnupnQ80W37 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SnupnQ80W37 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SnupnQ80W37 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SnupnQ80W37 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SnupnQ80W37 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SnupnQ80W37 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SnupnQ80W37 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SnupnQ80W37 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SnupnQ80W37 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SnupnQ80W37 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SnupnQ80W37 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SnupnQ80W37 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SnupnQ80W37 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SnupnQ80W37 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SnupnQ80W37 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SnupnQ80W37 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SnupnQ80W37 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SnupnQ80W37 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SnupnQ80W37 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SnupnQ80W37 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SnupnQ80W37 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SnupnQ80W37 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SnupnQ80W37 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SnupnQ80W37 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SnupnQ80W37 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SnupnQ80W37 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SnupnQ80W37 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SnupnQ80W37 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.5 ms