Protein–RNA interactions for Protein: Q80W04

Tmcc2, Transmembrane and coiled-coil domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmcc2Q80W04 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmcc2Q80W04 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tmcc2Q80W04 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Tmcc2Q80W04 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmcc2Q80W04 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmcc2Q80W04 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmcc2Q80W04 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmcc2Q80W04 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmcc2Q80W04 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmcc2Q80W04 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmcc2Q80W04 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmcc2Q80W04 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmcc2Q80W04 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmcc2Q80W04 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmcc2Q80W04 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmcc2Q80W04 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmcc2Q80W04 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmcc2Q80W04 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmcc2Q80W04 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmcc2Q80W04 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmcc2Q80W04 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmcc2Q80W04 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmcc2Q80W04 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmcc2Q80W04 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmcc2Q80W04 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmcc2Q80W04 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmcc2Q80W04 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmcc2Q80W04 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmcc2Q80W04 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmcc2Q80W04 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmcc2Q80W04 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmcc2Q80W04 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmcc2Q80W04 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmcc2Q80W04 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmcc2Q80W04 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmcc2Q80W04 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmcc2Q80W04 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmcc2Q80W04 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmcc2Q80W04 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmcc2Q80W04 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmcc2Q80W04 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmcc2Q80W04 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmcc2Q80W04 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmcc2Q80W04 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmcc2Q80W04 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmcc2Q80W04 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmcc2Q80W04 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmcc2Q80W04 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmcc2Q80W04 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmcc2Q80W04 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmcc2Q80W04 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmcc2Q80W04 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmcc2Q80W04 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmcc2Q80W04 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmcc2Q80W04 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmcc2Q80W04 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tmcc2Q80W04 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmcc2Q80W04 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmcc2Q80W04 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmcc2Q80W04 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmcc2Q80W04 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmcc2Q80W04 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmcc2Q80W04 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmcc2Q80W04 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmcc2Q80W04 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmcc2Q80W04 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmcc2Q80W04 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmcc2Q80W04 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmcc2Q80W04 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmcc2Q80W04 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmcc2Q80W04 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmcc2Q80W04 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmcc2Q80W04 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmcc2Q80W04 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmcc2Q80W04 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmcc2Q80W04 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmcc2Q80W04 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmcc2Q80W04 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmcc2Q80W04 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmcc2Q80W04 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmcc2Q80W04 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmcc2Q80W04 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmcc2Q80W04 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmcc2Q80W04 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmcc2Q80W04 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmcc2Q80W04 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmcc2Q80W04 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmcc2Q80W04 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmcc2Q80W04 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmcc2Q80W04 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmcc2Q80W04 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmcc2Q80W04 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmcc2Q80W04 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmcc2Q80W04 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmcc2Q80W04 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmcc2Q80W04 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmcc2Q80W04 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmcc2Q80W04 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmcc2Q80W04 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmcc2Q80W04 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms