Protein–RNA interactions for Protein: Q80UW8

Polr2e, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2eQ80UW8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Polr2eQ80UW8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Polr2eQ80UW8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Polr2eQ80UW8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Polr2eQ80UW8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Polr2eQ80UW8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Polr2eQ80UW8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Polr2eQ80UW8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Polr2eQ80UW8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Polr2eQ80UW8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Polr2eQ80UW8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Polr2eQ80UW8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Polr2eQ80UW8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Polr2eQ80UW8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Polr2eQ80UW8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Polr2eQ80UW8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Polr2eQ80UW8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Polr2eQ80UW8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Polr2eQ80UW8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Polr2eQ80UW8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Polr2eQ80UW8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Polr2eQ80UW8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Polr2eQ80UW8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Polr2eQ80UW8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Polr2eQ80UW8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Polr2eQ80UW8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Polr2eQ80UW8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Polr2eQ80UW8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Polr2eQ80UW8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Polr2eQ80UW8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Polr2eQ80UW8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Polr2eQ80UW8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Polr2eQ80UW8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Polr2eQ80UW8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Polr2eQ80UW8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Polr2eQ80UW8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Polr2eQ80UW8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Polr2eQ80UW8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Polr2eQ80UW8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Polr2eQ80UW8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Polr2eQ80UW8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Polr2eQ80UW8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Polr2eQ80UW8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Polr2eQ80UW8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Polr2eQ80UW8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Polr2eQ80UW8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Polr2eQ80UW8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Polr2eQ80UW8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Polr2eQ80UW8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Polr2eQ80UW8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Polr2eQ80UW8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Polr2eQ80UW8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Polr2eQ80UW8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Polr2eQ80UW8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Polr2eQ80UW8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Polr2eQ80UW8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Polr2eQ80UW8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Polr2eQ80UW8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Polr2eQ80UW8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Polr2eQ80UW8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Polr2eQ80UW8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Polr2eQ80UW8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Polr2eQ80UW8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Polr2eQ80UW8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Polr2eQ80UW8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Polr2eQ80UW8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Polr2eQ80UW8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Polr2eQ80UW8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Polr2eQ80UW8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Polr2eQ80UW8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Polr2eQ80UW8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Polr2eQ80UW8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Polr2eQ80UW8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Polr2eQ80UW8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Polr2eQ80UW8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Polr2eQ80UW8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Polr2eQ80UW8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Polr2eQ80UW8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Polr2eQ80UW8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Polr2eQ80UW8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Polr2eQ80UW8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Polr2eQ80UW8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Polr2eQ80UW8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Polr2eQ80UW8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Polr2eQ80UW8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Polr2eQ80UW8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Polr2eQ80UW8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Polr2eQ80UW8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Polr2eQ80UW8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Polr2eQ80UW8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Polr2eQ80UW8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Polr2eQ80UW8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Polr2eQ80UW8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Polr2eQ80UW8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Polr2eQ80UW8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Polr2eQ80UW8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Polr2eQ80UW8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Polr2eQ80UW8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Polr2eQ80UW8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Polr2eQ80UW8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms