Protein–RNA interactions for Protein: Q80U57

Rims3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims3Q80U57 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Rims3Q80U57 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rims3Q80U57 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Rims3Q80U57 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rims3Q80U57 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rims3Q80U57 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rims3Q80U57 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rims3Q80U57 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rims3Q80U57 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rims3Q80U57 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rims3Q80U57 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rims3Q80U57 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rims3Q80U57 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rims3Q80U57 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rims3Q80U57 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rims3Q80U57 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rims3Q80U57 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rims3Q80U57 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rims3Q80U57 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rims3Q80U57 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rims3Q80U57 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rims3Q80U57 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rims3Q80U57 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rims3Q80U57 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rims3Q80U57 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rims3Q80U57 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rims3Q80U57 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rims3Q80U57 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rims3Q80U57 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rims3Q80U57 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rims3Q80U57 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rims3Q80U57 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rims3Q80U57 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rims3Q80U57 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rims3Q80U57 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rims3Q80U57 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rims3Q80U57 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rims3Q80U57 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rims3Q80U57 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Rims3Q80U57 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Rims3Q80U57 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rims3Q80U57 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rims3Q80U57 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rims3Q80U57 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rims3Q80U57 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rims3Q80U57 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rims3Q80U57 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rims3Q80U57 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rims3Q80U57 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rims3Q80U57 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rims3Q80U57 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rims3Q80U57 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rims3Q80U57 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rims3Q80U57 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rims3Q80U57 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rims3Q80U57 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rims3Q80U57 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rims3Q80U57 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rims3Q80U57 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rims3Q80U57 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rims3Q80U57 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rims3Q80U57 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rims3Q80U57 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rims3Q80U57 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rims3Q80U57 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rims3Q80U57 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rims3Q80U57 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rims3Q80U57 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rims3Q80U57 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rims3Q80U57 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rims3Q80U57 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rims3Q80U57 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Rims3Q80U57 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rims3Q80U57 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rims3Q80U57 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rims3Q80U57 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rims3Q80U57 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rims3Q80U57 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rims3Q80U57 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rims3Q80U57 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rims3Q80U57 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rims3Q80U57 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rims3Q80U57 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rims3Q80U57 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rims3Q80U57 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rims3Q80U57 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rims3Q80U57 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rims3Q80U57 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rims3Q80U57 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rims3Q80U57 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rims3Q80U57 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rims3Q80U57 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rims3Q80U57 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rims3Q80U57 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rims3Q80U57 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rims3Q80U57 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rims3Q80U57 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rims3Q80U57 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rims3Q80U57 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rims3Q80U57 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms