Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC52.34■■■■■ 5.97
NischQ80TM9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC52.34■■■■■ 5.97
NischQ80TM9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.31■■■■■ 5.96
NischQ80TM9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.31■■■■■ 5.96
NischQ80TM9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC52.3■■■■■ 5.96
NischQ80TM9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.3■■■■■ 5.96
NischQ80TM9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.3■■■■■ 5.96
NischQ80TM9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.29■■■■■ 5.96
NischQ80TM9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.28■■■■■ 5.96
NischQ80TM9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.26■■■■■ 5.96
NischQ80TM9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC52.21■■■■■ 5.95
NischQ80TM9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.2■■■■■ 5.95
NischQ80TM9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.2■■■■■ 5.95
NischQ80TM9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC52.18■■■■■ 5.94
NischQ80TM9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC52.17■■■■■ 5.94
NischQ80TM9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC52.15■■■■■ 5.94
NischQ80TM9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC52.15■■■■■ 5.94
NischQ80TM9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC52.14■■■■■ 5.94
NischQ80TM9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC52.13■■■■■ 5.94
NischQ80TM9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC52.13■■■■■ 5.94
NischQ80TM9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.12■■■■■ 5.93
NischQ80TM9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC52.09■■■■■ 5.93
NischQ80TM9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.09■■■■■ 5.93
NischQ80TM9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC52.08■■■■■ 5.93
NischQ80TM9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC52.07■■■■■ 5.93
NischQ80TM9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.07■■■■■ 5.93
NischQ80TM9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.07■■■■■ 5.93
NischQ80TM9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC52.06■■■■■ 5.92
NischQ80TM9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC52.05■■■■■ 5.92
NischQ80TM9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC52.05■■■■■ 5.92
NischQ80TM9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.02■■■■■ 5.92
NischQ80TM9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC52.01■■■■■ 5.92
NischQ80TM9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC52.01■■■■■ 5.92
NischQ80TM9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.01■■■■■ 5.92
NischQ80TM9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52■■■■■ 5.92
NischQ80TM9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52■■■■■ 5.91
NischQ80TM9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC52■■■■■ 5.91
NischQ80TM9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC51.98■■■■■ 5.91
NischQ80TM9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC51.97■■■■■ 5.91
NischQ80TM9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC51.96■■■■■ 5.91
NischQ80TM9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.94■■■■■ 5.91
NischQ80TM9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC51.94■■■■■ 5.91
NischQ80TM9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC51.94■■■■■ 5.9
NischQ80TM9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.93■■■■■ 5.9
NischQ80TM9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC51.91■■■■■ 5.9
NischQ80TM9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.89■■■■■ 5.9
NischQ80TM9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC51.89■■■■■ 5.9
NischQ80TM9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC51.89■■■■■ 5.9
NischQ80TM9 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.88■■■■■ 5.9
NischQ80TM9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC51.87■■■■■ 5.89
NischQ80TM9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC51.87■■■■■ 5.89
NischQ80TM9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.86■■■■■ 5.89
NischQ80TM9 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC51.85■■■■■ 5.89
NischQ80TM9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC51.85■■■■■ 5.89
NischQ80TM9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.85■■■■■ 5.89
NischQ80TM9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC51.85■■■■■ 5.89
NischQ80TM9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC51.84■■■■■ 5.89
NischQ80TM9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC51.84■■■■■ 5.89
NischQ80TM9 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC51.84■■■■■ 5.89
NischQ80TM9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC51.83■■■■■ 5.89
NischQ80TM9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC51.83■■■■■ 5.89
NischQ80TM9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC51.83■■■■■ 5.89
NischQ80TM9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.83■■■■■ 5.89
NischQ80TM9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC51.82■■■■■ 5.89
NischQ80TM9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC51.82■■■■■ 5.89
NischQ80TM9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC51.82■■■■■ 5.89
NischQ80TM9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC51.82■■■■■ 5.89
NischQ80TM9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC51.82■■■■■ 5.89
NischQ80TM9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC51.79■■■■■ 5.88
NischQ80TM9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC51.78■■■■■ 5.88
NischQ80TM9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC51.77■■■■■ 5.88
NischQ80TM9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.76■■■■■ 5.88
NischQ80TM9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC51.74■■■■■ 5.87
NischQ80TM9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC51.74■■■■■ 5.87
NischQ80TM9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC51.74■■■■■ 5.87
NischQ80TM9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.74■■■■■ 5.87
NischQ80TM9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC51.74■■■■■ 5.87
NischQ80TM9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC51.72■■■■■ 5.87
NischQ80TM9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC51.7■■■■■ 5.87
NischQ80TM9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.7■■■■■ 5.87
NischQ80TM9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC51.69■■■■■ 5.87
NischQ80TM9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC51.67■■■■■ 5.86
NischQ80TM9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC51.67■■■■■ 5.86
NischQ80TM9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC51.66■■■■■ 5.86
NischQ80TM9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC51.66■■■■■ 5.86
NischQ80TM9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC51.65■■■■■ 5.86
NischQ80TM9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.65■■■■■ 5.86
NischQ80TM9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC51.65■■■■■ 5.86
NischQ80TM9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC51.63■■■■■ 5.86
NischQ80TM9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC51.63■■■■■ 5.86
NischQ80TM9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC51.63■■■■■ 5.86
NischQ80TM9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.63■■■■■ 5.86
NischQ80TM9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.6■■■■■ 5.85
NischQ80TM9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC51.6■■■■■ 5.85
NischQ80TM9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.6■■■■■ 5.85
NischQ80TM9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.57■■■■■ 5.85
NischQ80TM9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC51.54■■■■■ 5.84
NischQ80TM9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.54■■■■■ 5.84
NischQ80TM9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.51■■■■■ 5.84
NischQ80TM9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC51.5■■■■■ 5.84
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