Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT79

Mcph1, Microcephalin, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcph1Q7TT79 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Mcph1Q7TT79 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Mcph1Q7TT79 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Mcph1Q7TT79 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Mcph1Q7TT79 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Mcph1Q7TT79 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Mcph1Q7TT79 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Mcph1Q7TT79 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Mcph1Q7TT79 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Mcph1Q7TT79 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Mcph1Q7TT79 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Mcph1Q7TT79 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Mcph1Q7TT79 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Mcph1Q7TT79 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Mcph1Q7TT79 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Mcph1Q7TT79 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Mcph1Q7TT79 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Mcph1Q7TT79 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Mcph1Q7TT79 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Mcph1Q7TT79 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Mcph1Q7TT79 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Mcph1Q7TT79 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Mcph1Q7TT79 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Mcph1Q7TT79 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Mcph1Q7TT79 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Mcph1Q7TT79 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Mcph1Q7TT79 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Mcph1Q7TT79 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Mcph1Q7TT79 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Mcph1Q7TT79 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Mcph1Q7TT79 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Mcph1Q7TT79 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Mcph1Q7TT79 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Mcph1Q7TT79 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Mcph1Q7TT79 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Mcph1Q7TT79 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Mcph1Q7TT79 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Mcph1Q7TT79 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Mcph1Q7TT79 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Mcph1Q7TT79 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Mcph1Q7TT79 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Mcph1Q7TT79 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Mcph1Q7TT79 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Mcph1Q7TT79 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Mcph1Q7TT79 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Mcph1Q7TT79 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Mcph1Q7TT79 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Mcph1Q7TT79 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Mcph1Q7TT79 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Mcph1Q7TT79 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Mcph1Q7TT79 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Mcph1Q7TT79 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Mcph1Q7TT79 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Mcph1Q7TT79 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Mcph1Q7TT79 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Mcph1Q7TT79 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Mcph1Q7TT79 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Mcph1Q7TT79 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Mcph1Q7TT79 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Mcph1Q7TT79 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Mcph1Q7TT79 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Mcph1Q7TT79 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Mcph1Q7TT79 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Mcph1Q7TT79 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Mcph1Q7TT79 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Mcph1Q7TT79 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Mcph1Q7TT79 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Mcph1Q7TT79 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Mcph1Q7TT79 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Mcph1Q7TT79 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Mcph1Q7TT79 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Mcph1Q7TT79 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Mcph1Q7TT79 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Mcph1Q7TT79 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Mcph1Q7TT79 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Mcph1Q7TT79 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Mcph1Q7TT79 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Mcph1Q7TT79 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Mcph1Q7TT79 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Mcph1Q7TT79 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Mcph1Q7TT79 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Mcph1Q7TT79 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Mcph1Q7TT79 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Mcph1Q7TT79 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Mcph1Q7TT79 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Mcph1Q7TT79 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Mcph1Q7TT79 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Mcph1Q7TT79 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Mcph1Q7TT79 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Mcph1Q7TT79 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Mcph1Q7TT79 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Mcph1Q7TT79 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Mcph1Q7TT79 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Mcph1Q7TT79 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Mcph1Q7TT79 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Mcph1Q7TT79 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Mcph1Q7TT79 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Mcph1Q7TT79 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Mcph1Q7TT79 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Mcph1Q7TT79 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms